コード例 #1
0
def test_mmtf_nofilename(tmpdir):
    """See issue #23"""
    # Everyone's favourite BRD4 model
    u = mda.fetch_mmtf('4LYI')

    with tmpdir.as_cwd():
        pkas = propkatraj.get_propka(u)
        assert os.path.isfile('current.pka')
コード例 #2
0
ファイル: test_mmtf.py プロジェクト: zhenyuwei99/mdanalysis
    def u(self):
        top = mmtf.parse(MMTF)
        with mock.patch('mmtf.fetch') as mock_fetch:
            mock_fetch.return_value = top

            return mda.fetch_mmtf('173D')  # string is irrelevant
コード例 #3
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ファイル: test_mmtf.py プロジェクト: kaplajon/mdanalysis
 def setUp(self, mock_fetch):
     top = mmtf.parse(MMTF)
     mock_fetch.return_value = top
     self.u = mda.fetch_mmtf('173D')  # string is irrelevant
コード例 #4
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ファイル: test_mmtf.py プロジェクト: MDAnalysis/mdanalysis
    def u(self):
        top = mmtf.parse(MMTF)
        with mock.patch('mmtf.fetch') as mock_fetch:
            mock_fetch.return_value = top

            return mda.fetch_mmtf('173D')  # string is irrelevant