Python PDB_util.Atom2pdbの例

コード例 #1

ファイル: Pose.py プロジェクト: jfried23/pdbedit

 def __str__(self):
     data = ''
     for chain in self.__iter__():
         for rnum, residue in enumerate(chain):
             for offset, atom in enumerate(residue):
                 data += PDB_util.Atom2pdb(atom)
         ter = atom
         ter.set_param('atm_type', 'TER')
         ter.set_param('atm_name', ' ')
         data += PDB_util.Atom2pdb(atom)[0:26] + '\n'
     data += 'END'
     return data

コード例 #2

ファイル: Residue.py プロジェクト: jfried23/pdbedit

 def __str__(self):
     data = ''
     for atom in self.__iter__():
         data += PDB_util.Atom2pdb(atom)
     return data

コード例 #3

ファイル: Atom.py プロジェクト: jfried23/pdbedit

 def __str__(self):
     return PDB_util.Atom2pdb(self)