Python calc_lfp_pointsource_anisotropicの例

コード例 #1

ファイル: test_lfpcalc.py プロジェクト: torbjone/LFPy

    def test_calc_lfp_pointsource_anisotropic(self):

        sigma = [0.6, 0.3, 0.45]
        cell = TestCell()
        cell.xmid = cell.ymid = cell.zmid = np.array([1.2])
        sigma_r = np.sqrt(sigma[1] * sigma[2] * 1.2**2
                        + sigma[0] * sigma[2] * 1.2**2
                        + sigma[0] * sigma[1] * 1.2**2)

        phi_analytic = 1./(4*np.pi * sigma_r)
        np.testing.assert_equal(phi_analytic,
                                lfpcalc.calc_lfp_pointsource_anisotropic(cell,
                                x=0, y=0, z=0, sigma=sigma,
                                r_limit=cell.diam/2))

コード例 #2

ファイル: test_lfpcalc.py プロジェクト: liamlong01/ClosedLoopBiophysics

    def test_calc_lfp_pointsource_anisotropic(self):

        sigma = [0.6, 0.3, 0.45]
        cell = DummyCell()
        cell.xmid = cell.ymid = cell.zmid = np.array([1.2])
        sigma_r = np.sqrt(sigma[1] * sigma[2] * 1.2**2
                        + sigma[0] * sigma[2] * 1.2**2
                        + sigma[0] * sigma[1] * 1.2**2)

        phi_analytic = 1./(4*np.pi * sigma_r)
        np.testing.assert_equal(phi_analytic,
                                lfpcalc.calc_lfp_pointsource_anisotropic(cell,
                                x=0, y=0, z=0, sigma=sigma,
                                r_limit=cell.diam/2))