Python VaspChecker.read_my_displacement_fileの例

コード例 #1

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: uw-cmg/MAST

 def test_read_my_displacement_file(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords["name"], "XDATCAR_vasp522")
     self.assertEqual(mydisp["numatoms"], 4)
     self.assertEqual(mydisp["configs"][6][0], "   0.00000000  0.00000000  0.00286262\n")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords["name"], "XDATCAR_vasp5211")
     self.assertEqual(mydisp["numatoms"], 4)
     self.assertEqual(mydisp["configs"][2][1], "   0.50244722  0.50000000  0.00000000\n")

コード例 #2

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: uw-cmg/MAST

 def test_combine_displacement_files(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics_split")
     myvc.combine_displacement_files()
     shutil.move(os.path.join(testdir, "dynamics_split/XDATCAR"), os.path.join(testdir, "childdir"))
     shutil.move(os.path.join(testdir, "dynamics_split/XDATCAR_combined"), os.path.join(testdir, "childdir"))
     disp_compare = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords["name"], "XDATCAR_compare")
     disp_combined = myvc.read_my_displacement_file("childdir", "XDATCAR_combined")
     print "COMPARE"
     for key, value in disp_compare.iteritems():
         self.assertEqual(value, disp_combined[key])

コード例 #3

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: uw-cmg/MAST

 def test_write_my_displacement_file(self):
     myvc = VaspChecker(name="childdir")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics", "XDATCAR_vasp5211")
     myvc.write_my_displacement_file(mydisp)
     mydisp2 = myvc.read_my_displacement_file()
     self.assertEqual(mydisp, mydisp2)
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics", "XDATCAR_vasp522")
     myvc.write_my_displacement_file(mydisp)
     mydisp2 = myvc.read_my_displacement_file()
     self.assertEqual(mydisp, mydisp2)

コード例 #4

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: zhenming-xu/MAST

 def test_write_my_displacement_file(self):
     myvc = VaspChecker(name="childdir")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics", "XDATCAR_vasp5211")
     myvc.write_my_displacement_file(mydisp)
     mydisp2 = myvc.read_my_displacement_file()
     self.assertEqual(mydisp, mydisp2)
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics", "XDATCAR_vasp522")
     myvc.write_my_displacement_file(mydisp)
     mydisp2 = myvc.read_my_displacement_file()
     self.assertEqual(mydisp, mydisp2)

コード例 #5

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: zhenming-xu/MAST

 def test_read_my_displacement_file(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords['name'],
                                             "XDATCAR_vasp522")
     self.assertEqual(mydisp['numatoms'], 4)
     self.assertEqual(mydisp['configs'][6][0],
                      "   0.00000000  0.00000000  0.00286262\n")
     mydisp = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords['name'],
                                             "XDATCAR_vasp5211")
     self.assertEqual(mydisp['numatoms'], 4)
     self.assertEqual(mydisp['configs'][2][1],
                      "   0.50244722  0.50000000  0.00000000\n")

コード例 #6

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: zhenming-xu/MAST

 def test_combine_displacement_files(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics_split")
     myvc.combine_displacement_files()
     shutil.move(os.path.join(testdir, "dynamics_split/XDATCAR"),
                 os.path.join(testdir, "childdir"))
     shutil.move(os.path.join(testdir, "dynamics_split/XDATCAR_combined"),
                 os.path.join(testdir, "childdir"))
     disp_compare = myvc.read_my_displacement_file(myvc.keywords['name'],
                                                   "XDATCAR_compare")
     disp_combined = myvc.read_my_displacement_file("childdir",
                                                    "XDATCAR_combined")
     print "COMPARE"
     for key, value in disp_compare.iteritems():
         self.assertEqual(value, disp_combined[key])

コード例 #7

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: uw-cmg/MAST

 def test_forward_displacement(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics")
     myvc.forward_displacement_file(os.path.join(testdir, "childdir"))
     dp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics")
     dc = myvc.read_my_displacement_file("childdir")
     self.assertEqual(dp, dc)

コード例 #8

ファイル: test_vaspchecker.py プロジェクト: zhenming-xu/MAST

 def test_forward_displacement(self):
     myvc = VaspChecker(name="dynamics")
     myvc.forward_displacement_file(os.path.join(testdir, "childdir"))
     dp = myvc.read_my_displacement_file("dynamics")
     dc = myvc.read_my_displacement_file("childdir")
     self.assertEqual(dp, dc)