Python guess_torsionsの例

コード例 #1

ファイル: test_topology.py プロジェクト: ivirshup/mdanalysis

    def test_guess_torsions(self):
        ag = self.u.atoms[:10]
        ag.bonds
        ag.angles

        guessed_tors = guess_torsions(ag.angles)

        dump_result = ag.torsions.dump_contents()

        assert_equal(set(guessed_tors), set(dump_result))

コード例 #2

ファイル: test_topology.py プロジェクト: djay0529/mdanalysis

    def test_guess_torsions(self):
        ag = self.u.atoms[:10]
        ag.bonds
        ag.angles

        guessed_tors = guess_torsions(ag.angles)

        dump_result = ag.torsions.dump_contents()

        assert_equal(set(guessed_tors), set(dump_result))

コード例 #3

ファイル: test_topology.py プロジェクト: ivirshup/mdanalysis

    def test_guess_torsions_set(self):
        self.u.torsions = guess_torsions(self.u.angles)

        assert_equal(len(self.u.torsions), 8921)

コード例 #4

ファイル: test_topology.py プロジェクト: djay0529/mdanalysis

    def test_guess_torsions_set(self):
        self.u.torsions = guess_torsions(self.u.angles)

        assert_equal(len(self.u.torsions), 8921)