コード例 #1
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ファイル: __init__.py プロジェクト: pk-organics/SEQCROW
 def open(self, session, data, file_name, **kw):
     return open_aarontools(
         session,
         data,
         file_name,
         format_name="Gaussian output file",
         **kw)
コード例 #2
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ファイル: __init__.py プロジェクト: pk-organics/SEQCROW
    def open_file(session, path, format_name, coordsets=False):
        """
        open an AaronTools-readable structure (see AaronTools.fileIO.read_types)
        session     - chimerax Session 
        path        - str, path to file
        format_name - str, file format
        coordsets   - bool, load as trajectory
        """
        from .io import open_aarontools

        session.logger.info("loading %s file" % format_name)

        return open_aarontools(session,
                               path,
                               format_name=format_name,
                               coordsets=coordsets)
コード例 #3
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ファイル: __init__.py プロジェクト: pk-organics/SEQCROW
 def open(self, session, data, file_name, **kw):
     return open_aarontools(session,
                            data,
                            file_name,
                            format_name="FCHK file",
                            **kw)