Python generate_tags_multiple_filesの例

コード例 #1

ファイル: mzidplus.py プロジェクト: ypriverol/msstitch

def mzid_specdata_generator(mzidfile, namespace):
    return basereader.generate_tags_multiple_files([mzidfile], 'SpectraData', [
        'cvList',
        'AnalysisSoftwareList',
        'SequenceCollection',
        'AnalysisProtocolCollection',
        'AnalysisCollection',
    ], namespace)

コード例 #2

ファイル: mzidplus.py プロジェクト: ypriverol/msstitch

def generate_mzid_peptides(mzidfile, namespace):
    return basereader.generate_tags_multiple_files([mzidfile], 'Peptide', [
        'cvList',
        'AnalysisSoftwareList',
        'DataCollection',
        'AnalysisProtocolCollection',
        'AnalysisCollection',
    ], namespace)

コード例 #3

ファイル: mzidplus.py プロジェクト: ypriverol/msstitch

def mzid_spec_result_generator(mzidfile, namespace):
    return basereader.generate_tags_multiple_files(
        [mzidfile], 'SpectrumIdentificationResult', [
            'cvList',
            'AnalysisSoftwareList',
            'SequenceCollection',
            'AnalysisProtocolCollection',
            'AnalysisCollection',
        ], namespace)

コード例 #4

def generate_peptides_multiple_fractions(input_files, ns):
    return basereader.generate_tags_multiple_files(input_files, 'peptide',
                                                   ['psm', 'protein'], ns)

コード例 #5

ファイル: pycolator.py プロジェクト: glormph/msstitch

def generate_peptides_multiple_fractions(input_files, ns):
    return basereader.generate_tags_multiple_files(input_files, 'peptide',
                                                   ['psm', 'protein'], ns)