Python write_conの例

コード例 #1

#!/usr/bin/env python
import aselite
import numpy as np
from sys import argv, exit

if len(argv) < 3 or '-h' in argv:
    print "usage: xyz2con.py FILENAME BOXSIZE\n"
    exit(0)

filename = argv[1]
atoms = aselite.read_xyz(filename)

atoms.positions -= np.min(atoms.positions)
a = float(argv[2])
atoms.set_cell((a, a, a))

aselite.write_con(filename.replace('xyz', 'con'), atoms)

コード例 #2

ファイル: xyz2con.py プロジェクト: qzhang62/vasp_analysis

#!/usr/bin/env python
import aselite
import numpy as np
from sys import argv, exit

if len(argv) < 3 or '-h' in argv:
    print "usage: xyz2con.py FILENAME BOXSIZE\n"
    exit(0)
    
filename = argv[1]
atoms = aselite.read_xyz(filename)

atoms.positions -= np.min(atoms.positions)
a = float(argv[2])
atoms.set_cell((a,a,a))


aselite.write_con(filename.replace('xyz', 'con'), atoms)

コード例 #3

ファイル: 2con.py プロジェクト: qzhang62/vasp_analysis

#!/usr/bin/env python
import sys
import aselite

if len(sys.argv) < 3:
    print 'usage: 2con.py IN OUT'
    print '       converts file IN of type POSCAR or xyz to con and saves it to OUT'
    print
    sys.exit(0)

traj = aselite.read_any(sys.argv[1])
aselite.write_con(sys.argv[2], traj)