コード例 #1
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ファイル: test_utils.py プロジェクト: yilinxu/augur
 def test_load_mask_sites_recognizes_non_bed_file(self, m_read_mask_file):
     """load_mask_sites should pass any other files to read_mask_file"""
     m_read_mask_file.return_value = [5, 6]
     assert utils.load_mask_sites("mask.not_a_bed")
     m_read_mask_file.assert_called_with("mask.not_a_bed")
コード例 #2
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ファイル: test_utils.py プロジェクト: yilinxu/augur
 def test_load_mask_sites_recognizes_bed_file(self, m_read_bed_file,
                                              extension):
     """load_mask_sites should handle files that end with .bed with any capitalization as a bed"""
     m_read_bed_file.return_value = [3, 4]
     assert utils.load_mask_sites("mask.%s" % extension) == [3, 4]
     m_read_bed_file.assert_called_with("mask.%s" % extension)