コード例 #1
0
 def __init__(self):
     clusterBaseClass.__init__(self,
                               outputPostfix=SRAParser.SRAParser.outputPostfix,
                               baseSplitDir='/cellar/users/btsui/Data/nrnb01_nobackup/tmp/METAMAP//splittedInput_' + self.className + '_',
                               pythonScriptName='/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap/SRAParser.py',
                               CWD='/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap',
                               minCorrectSize=0,
                               memory=2,
                               smp=1
                               )
コード例 #2
0
 def __init__(self):
     clusterBaseClass.__init__(
         self,
         outputPostfix=MetamapParse.outputPostfix,
         baseSplitDir=
         '/cellar/users/btsui/Data/nrnb01_nobackup/METAMAP/splittedInput_',
         pythonScriptName=
         '/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap/MetamapParser.py',
         CWD='/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap',
         minCorrectSize=1)
コード例 #3
0
ファイル: quantileManager.py プロジェクト: chbe-helix/Seqmap
 def __init__(self):
     clusterBaseClass.__init__(
         self,
         outputPostfix=quantile.outputPostfix,
         baseSplitDir='/oasis/btsui/tmp/METAMAP//splittedInput_' +
         self.className + '_',
         pythonScriptName=
         '/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap/quantile.py',
         CWD='/cellar/users/btsui/Project/METAMAP/code/metamap',
         minCorrectSize=0,
         memory=10,
         smp=1)
     self.setNFiles(100)