コード例 #1
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ファイル: test_blast_xml.py プロジェクト: aglucaci/cogent3
 def test_parse_header(self):
     """Fields from XML header tag should be available as dict."""
     data = parse_header(self.header)
     self.assertEqual(data.get("application"), "my Grandma")
     self.assertEqual(data.get("version"), "has")
     self.assertEqual(data.get("reference"), "furry")
     self.assertEqual(data.get("query_letters"), 27)
     self.assertEqual(data.get("database"), "Cats")
コード例 #2
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ファイル: test_blast_xml.py プロジェクト: aglucaci/cogent3
 def test_parse_header_complete(self):
     """Fields from header+param tag should be available as dict."""
     # try to process header with parameters etc in the XML
     data = parse_header(self.complete)
     self.assertEqual(data.get("database"), "Cats")
     self.assertEqual(data.get("matrix"), "BLOSUM62")