Python MakeBlastDBTask.get_stageの例

コード例 #1

ファイル: dataimport.py プロジェクト: ssirimulla/D3R

 def __init__(self, path, args):
     super(DataImportTask, self).__init__(path, args)
     self.set_name(DataImportTask.TASK_NAME)
     makeblast = MakeBlastDBTask('', args)
     self.set_stage(makeblast.get_stage() + 1)
     self.set_status(D3RTask.UNKNOWN_STATUS)
     self._maxretries = 3
     self._retrysleep = 1

コード例 #2

ファイル: test_makeblastdb.py プロジェクト: ssirimulla/D3R

 def test_constructor(self):
     params = D3RParameters()
     task = MakeBlastDBTask('/foo', params)
     self.assertEqual(task.get_name(), 'makeblastdb')
     self.assertEqual(task.get_stage(), 1)
     self.assertEqual(task.get_status(), D3RTask.UNKNOWN_STATUS)
     self.assertEqual(task.get_path(), '/foo')
     self.assertEqual(task.get_dir_name(), 'stage.1.makeblastdb')
     test_task.try_update_status_from_filesystem(self, task)