Python fly_trajectory_analyzerの例

コード例 #1

ファイル: osmotropotaxis_test.py プロジェクト: SashaRayshubskiy/osmotropotaxis_analysis_python

 def __init__(self, exp_mdata, data_loader):
     self.fly_traj_analyzer = fta.fly_trajectory_analyzer(exp_mdata, data_loader.trial_data_all)

コード例 #2

ファイル: run_test.py プロジェクト: SashaRayshubskiy/osmotropotaxis_analysis_python

__author__ = 'sasha'


# Load the data into the environment
import osmotropotaxis_main
d = osmotropotaxis_main.osmotropotaxis_main()
d.run()
# Init analyzer
import fly_trajectory_analyzer as fta
fly_traj_analyzer = fta.fly_trajectory_analyzer(d.exp_mdata, d.loader.trial_data_all)



# Show analysis, new analysis, new method
fly_traj_analyzer.show_avg_velocity_response()

# Show classifier
fly_traj_analyzer.show_classifier('AgglomerativeClustering', 4)

#
fly_traj_analyzer.show_fwd_and_lat_velocity_bar_plots_for_each_trial()

#
fly_traj_analyzer.show_trajectories()

#
fly_traj_analyzer.show_PCA_analysis()

#
fly_traj_analyzer.show_PCA_2D_scatter_analysis()