Python PropertyGraph.PropertyGraphの例

コード例 #1

ファイル: bfs.py プロジェクト: pamvc/katana

def main():
    import argparse
    from galois.shmem import setActiveThreads

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--startNode", type=int, default=0)
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--noverify", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--cython", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("input", type=str)

    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    graph = PropertyGraph(args.input)

    if args.cython:
        cython_bfs(graph, args.startNode, args.propertyName)
    else:
        bfs_sync_pg(graph, args.startNode, args.propertyName)

    print("Node {}: {}".format(
        args.reportNode,
        graph.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

    if not args.noverify:
        numNodeProperties = len(graph.node_schema())
        newPropertyId = numNodeProperties - 1
        if args.cython:
            cython_verify_bfs(graph, args.startNode, newPropertyId)
        else:
            verify_bfs(graph, args.startNode, newPropertyId)

コード例 #2

def main():
    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--algoType", type=str, default="push")
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--noverify", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("input", type=str)
    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    graph = PropertyGraph(args.input)

    if args.algoType == "push":
        cc_push_topo(graph, args.propertyName)
    else:
        cc_pull_topo(graph, args.propertyName)

    print("Node {}: {}".format(args.reportNode, graph.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

    if not args.noverify:
        numNodeProperties = len(graph.node_schema())
        newPropertyId = numNodeProperties - 1
        verify_cc(graph, newPropertyId)

コード例 #3

def main():
    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--startNode", type=int, default=0)
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--edgeWeightProperty", type=str, required=True)
    parser.add_argument("--shift", type=int, default=6)
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--noverify", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("input", type=str)
    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    graph = PropertyGraph(args.input)

    sssp(graph, args.startNode, args.edgeWeightProperty, args.shift,
         args.propertyName)

    print("Node {}: {}".format(
        args.reportNode,
        graph.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

    if not args.noverify:
        numNodeProperties = len(graph.node_schema())
        newPropertyId = numNodeProperties - 1
        verify_sssp(graph, args.startNode, newPropertyId)

コード例 #4

def test_load_garbage_file():
    fi = NamedTemporaryFile(delete=False)
    try:
        with fi:
            fi.write(b"Test")
        with pytest.raises(TsubaError):
            PropertyGraph(fi.name)
    finally:
        os.unlink(fi.name)

コード例 #5

ファイル: kcore.py プロジェクト: spacewalkman/katana

def main():
    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--noverify", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--kcore", "-k", type=int, default=100)
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=0)
    parser.add_argument("input", type=str)
    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    graph = PropertyGraph(args.input)

    kcore_async(graph, args.kcore, args.propertyName)

    print("Node {}: {}".format(
        args.reportNode,
        graph.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

    if not args.noverify:
        verify_kcore(graph, args.propertyName, args.kcore)

コード例 #6

def main():
    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--baseNode", type=int, default=0)
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("input", type=str)
    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    g = PropertyGraph(args.input)

    timer = StatTimer("Jaccard (Property Graph) Numba")
    timer.start()
    jaccard(g, args.baseNode, args.propertyName)
    timer.stop()
    # del timer

    print("Node {}: {}".format(
        args.reportNode,
        g.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

コード例 #7

ファイル: pagerank.py プロジェクト: spacewalkman/katana

def main():
    import argparse

    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("--propertyName", type=str, default="NewProperty")
    parser.add_argument("--maxIterations", type=int, default=100)
    parser.add_argument("--tolerance", type=float, default=1.0e-3)
    parser.add_argument("--noverify", action="store_true", default=False)
    parser.add_argument("--printTopN", type=int, default=10)
    parser.add_argument("--threads", "-t", type=int, default=1)
    parser.add_argument("--reportNode", type=int, default=0)
    parser.add_argument("input", type=str)
    args = parser.parse_args()

    print("Using threads:", setActiveThreads(args.threads))

    graph = PropertyGraph(args.input)

    pagerank_pull_sync_residual(graph, args.maxIterations, args.tolerance, args.propertyName)

    print("Node {}: {}".format(args.reportNode, graph.get_node_property(args.propertyName)[args.reportNode]))

    if not args.noverify:
        verify_pr(graph, args.propertyName, args.printTopN)

コード例 #8

ファイル: conftest.py プロジェクト: spacewalkman/katana

def property_graph():
    g = PropertyGraph(get_input("propertygraphs/ldbc_003"))
    return g

コード例 #9

def test_load_directory():
    with pytest.raises(TsubaError):
        PropertyGraph("/tmp")

コード例 #10

def test_load_invalid_path():
    with pytest.raises(TsubaError):
        PropertyGraph("non-existent")