Python ANOVA._get_one_drug_one_feature_dataの例

コード例 #1

ファイル: test_boxplots.py プロジェクト: howard-lightfoot/gdsctools

def test_get_boxplot_data():
    an = ANOVA(ic50_test)
    odof = an._get_one_drug_one_feature_data('Drug_1047_IC50','TP53_mut')

    bb = BoxPlots(odof)

    data = bb._get_boxplot_data(mode='msi')
    assert data[1] == ['***MSI-stable neg', '***MSI-stable pos',
                  '**MSI-unstable neg',  '**MSI-unstable pos']
    expected = [2.0108071495663922e-47, 0.0012564798887037905]
    assert_list_almost_equal([data[2][0], data[2][1]], expected)  

コード例 #2

ファイル: test_boxplots.py プロジェクト: shukwong/gdsctools

def test_get_boxplot_data():
    an = ANOVA(ic50_test)
    odof = an._get_one_drug_one_feature_data(1047, 'TP53_mut')

    bb = BoxPlots(odof)

    data = bb._get_boxplot_data(mode='msi')
    assert data[1] == [
        '***MSI-stable neg', '***MSI-stable pos', '**MSI-unstable neg',
        '**MSI-unstable pos'
    ]
    expected = [2.0108071495663922e-47, 0.0012564798887037905]
    assert_list_almost_equal([data[2][0], data[2][1]], expected)