Python GenomeElement.createGeFromTrackElの例

コード例 #1

ファイル: TrackGenomeElementSource.py プロジェクト: brynjagr/gtrackcore

 def _wrappedTrackElsGenerator(self):
     track = self._getTrack()
     for region,tv in ((region, self._getTrackView(track, region)) for region in self._boundingRegions):
         for te in tv:
             yield GenomeElement.createGeFromTrackEl(te, tv.trackFormat, globalCoords=self._globalCoords)

コード例 #2

ファイル: Wrappers.py プロジェクト: gtrack/gtrackcore

 def next(self):
     trackEl = self._tvIter.next()
     ge = GenomeElement.createGeFromTrackEl(trackEl, self._tv.trackFormat)
     return ge

コード例 #3

ファイル: Wrappers.py プロジェクト: brynjagr/gtrackcore

 def next(self):
     trackEl = self._tvIter.next()
     ge = GenomeElement.createGeFromTrackEl(trackEl, self._tv.trackFormat)
     return ge

コード例 #4

 def _wrappedTrackElsGenerator(self):
     track = self._getTrack()
     for region,tv in ((region, self._getTrackView(track, region)) for region in self._boundingRegions):
         for te in tv:
             yield GenomeElement.createGeFromTrackEl(te, tv.trackFormat, globalCoords=self._globalCoords)