Python IterativeProatomMixin._finalize_proparsの例

コード例 #1

ファイル: mbis.py プロジェクト: FarnazH/hortonqa

 def _finalize_propars(self):
     IterativeProatomMixin._finalize_propars(self)
     propars = self.cache.load('propars')
     core_charges = []
     valence_charges = []
     valence_widths = []
     for iatom in xrange(self.natom):
         my_propars = propars[self._ranges[iatom]:self._ranges[iatom+1]]
         valence_charges.append(-my_propars[-2])
         valence_widths.append(1.0/my_propars[-1])
     valence_charges = np.array(valence_charges)
     valence_widths = np.array(valence_widths)
     core_charges = self._cache.load('charges') - valence_charges
     self.cache.dump('core_charges', core_charges, tags='o')
     self.cache.dump('valence_charges', valence_charges, tags='o')
     self.cache.dump('valence_widths', valence_widths, tags='o')

コード例 #2

ファイル: mbis.py プロジェクト: ruthfranklin/horton

 def _finalize_propars(self):
     IterativeProatomMixin._finalize_propars(self)
     propars = self.cache.load('propars')
     core_charges = []
     valence_charges = []
     valence_widths = []
     for iatom in xrange(self.natom):
         my_propars = propars[self._ranges[iatom]:self._ranges[iatom + 1]]
         valence_charges.append(-my_propars[-2])
         valence_widths.append(1.0 / my_propars[-1])
     valence_charges = np.array(valence_charges)
     valence_widths = np.array(valence_widths)
     core_charges = self._cache.load('charges') - valence_charges
     self.cache.dump('core_charges', core_charges, tags='o')
     self.cache.dump('valence_charges', valence_charges, tags='o')
     self.cache.dump('valence_widths', valence_widths, tags='o')