コード例 #1
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: fdurupinar/indra
def test_has_members_er():
    bpe = bp.model.getByID(uri_prefix +\
                     'ProteinReference_971cec47bcd850e2b7d602f0416edacf')
    bpe = cast(bpc._bp('ProteinReference'), bpe)
    assert (bpc._has_members(bpe))

    bpe = bp.model.getByID('http://identifiers.org/uniprot/P56159')
    bpe = cast(bpc._bp('ProteinReference'), bpe)
    assert (not bpc._has_members(bpe))
コード例 #2
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: jmuhlich/indra
def test_has_members_er():
    bpe = bp.model.getByID(uri_prefix +\
                     'ProteinReference_971cec47bcd850e2b7d602f0416edacf')
    bpe = cast(bpc._bp('ProteinReference'), bpe)
    assert(bpc._has_members(bpe))

    bpe = bp.model.getByID('http://identifiers.org/uniprot/P56159')
    bpe = cast(bpc._bp('ProteinReference'), bpe)
    assert(not bpc._has_members(bpe))
コード例 #3
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: fdurupinar/indra
def test_has_members_pe2():
    bpe = bp.model.getByID(uri_prefix +
                           'Protein_7d526475fd43d0a07ca1a596fe81aae0')
    bpe = cast(bpc._bp('Protein'), bpe)
    assert (not bpc._has_members(bpe))
コード例 #4
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: fdurupinar/indra
def test_has_members_pe():
    bpe = bp.model.getByID('http://identifiers.org/reactome/REACT_117345.2')
    bpe = cast(bpc._bp('Protein'), bpe)
    assert (bpc._has_members(bpe))
コード例 #5
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: jmuhlich/indra
def test_has_members_pe2():
    bpe = bp.model.getByID(uri_prefix + 'Protein_7d526475fd43d0a07ca1a596fe81aae0')
    bpe = cast(bpc._bp('Protein'), bpe)
    assert(not bpc._has_members(bpe))
コード例 #6
0
ファイル: test_biopax.py プロジェクト: jmuhlich/indra
def test_has_members_pe():
    bpe = bp.model.getByID('http://identifiers.org/reactome/REACT_117345.2')
    bpe = cast(bpc._bp('Protein'), bpe)
    assert(bpc._has_members(bpe))