コード例 #1
0
def test_get_item(data):
    dlen = get_dataset_lens(data)[0]
    assert dlen == 3
    assert len(set(get_dataset_lens(data))) == 1
    assert get_dataset_item(data, 1) == {
        "a": [1],
        "b": {
            "d": 1
        },
        "c": np.array([1])
    }
コード例 #2
0
ファイル: data.py プロジェクト: mmtrebuchet/bpnet-manuscript
def nested_numpy_minibatch(data, batch_size=1):
    lens = get_dataset_lens(data)
    if isinstance(lens, collections.Mapping):
        ln = [v for v in lens.values()][0]
    elif isinstance(lens, collections.Sequence):
        ln = lens[0]
    else:
        ln = lens

    for idx in BatchSampler(range(ln),
                            batch_size=batch_size,
                            drop_last=False):
        yield get_dataset_item(data, idx)
コード例 #3
0
def test_datset_lens_good(data):
    assert get_dataset_lens(data) == 3 * [3]
コード例 #4
0
def test_datset_lens_bad(bad_data):
    assert sorted(get_dataset_lens(bad_data)) == [1, 3, 3, 4]

    with pytest.raises(Exception):
        get_dataset_lens(bad_data, require_numpy=True)
コード例 #5
0
ファイル: data.py プロジェクト: VolkerH/kipoi
 def __init__(self, *args, **kwargs):
     self.data = self._get_data_fn()(*args, **kwargs)
     lens = get_dataset_lens(self.data, require_numpy=True)
     # check that all dimensions are the same
     assert len(set(lens)) == 1
     self.n = lens[0]