コード例 #1
0
ファイル: test_prodigal.py プロジェクト: biocore/micronota
 def test_run(self):
     for case in self.cases:
         exp_d = _get_named_data_path(case.outdir)
         obs_d = join(self.tmp_dir, case.outdir)
         run(case.query, obs_d, **case.kwargs)
         for f in listdir(exp_d):
             self.assertTrue(
                 cmp(join(obs_d, f), join(exp_d, f), shallow=False))
コード例 #2
0
ファイル: test_prodigal.py プロジェクト: biocore/micronota
 def test_wrong_input_fp(self):
     for fp in self.negative_fps:
         with self.assertRaisesRegex(
                 CalledProcessError,
                 'returned non-zero exit status'):
             run(fp, self.tmp_dir)
コード例 #3
0
 def test_wrong_input_fp(self):
     for fp in self.negative_fps:
         with self.assertRaisesRegex(CalledProcessError,
                                     'returned non-zero exit status'):
             run(fp, self.tmp_dir)