コード例 #1
0
ファイル: test_stats_sp.py プロジェクト: kirtyvedula/PyMVPA
    def test_chi_square(self, exp):
        """Test chi-square distribution"""
        # test equal distribution
        tbl = np.array([[5, 5], [5, 5]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp=exp)
        self.assertTrue(chi == 0.0)
        self.assertTrue(p == 1.0)

        # test perfect "generalization"
        tbl = np.array([[4, 0], [0, 4]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp=exp)
        self.assertTrue(chi == 8.0)
        self.assertTrue(p < 0.05)
コード例 #2
0
ファイル: test_stats_sp.py プロジェクト: jgors/PyMVPA
    def test_chi_square(self, exp):
        """Test chi-square distribution"""
        # test equal distribution
        tbl = np.array([[5, 5], [5, 5]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp=exp)
        self.assertTrue( chi == 0.0 )
        self.assertTrue( p == 1.0 )

        # test perfect "generalization"
        tbl = np.array([[4, 0], [0, 4]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp=exp)
        self.assertTrue(chi == 8.0)
        self.assertTrue(p < 0.05)
コード例 #3
0
ファイル: test_stats_sp.py プロジェクト: kirtyvedula/PyMVPA
    def test_chi_square_disbalanced(self):
        # test perfect "generalization"
        tbl = np.array([[1, 100], [1, 100]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp='indep_rows')
        self.assertTrue(chi == 0)
        self.assertTrue(p == 1)

        chi, p = chisquare(tbl, exp='uniform')
        self.assertTrue(chi > 194)
        self.assertTrue(p < 1e-10)

        # by default lets do uniform
        chi_, p_ = chisquare(tbl)
        self.assertTrue(chi == chi_)
        self.assertTrue(p == p_)
コード例 #4
0
ファイル: test_stats_sp.py プロジェクト: jgors/PyMVPA
    def test_chi_square_disbalanced(self):
        # test perfect "generalization"
        tbl = np.array([[1, 100], [1, 100]])
        chi, p = chisquare(tbl, exp='indep_rows')
        self.assertTrue(chi == 0)
        self.assertTrue(p == 1)

        chi, p = chisquare(tbl, exp='uniform')
        self.assertTrue(chi > 194)
        self.assertTrue(p < 1e-10)

        # by default lets do uniform
        chi_, p_ = chisquare(tbl)
        self.assertTrue(chi == chi_)
        self.assertTrue(p == p_)
コード例 #5
0
 def getconfusion(data):
     cv(data)
     return chisquare(cv.ca.stats.matrix)[0]
コード例 #6
0
ファイル: test_searchlight.py プロジェクト: kirty/PyMVPA
 def getconfusion(data):
     cv(data)
     return chisquare(cv.ca.stats.matrix)[0]