Python has_no_flat_neuritesの例

コード例 #1

def test_has_no_flat_neurites():

    _, n = _load_neuron('Neuron.swc')

    nt.assert_true(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance'))
    nt.assert_true(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio'))

    n = _make_flat(n)

    nt.assert_false(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance'))
    nt.assert_false(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio'))

コード例 #2

ファイル: test_neuron_checks.py プロジェクト: jdcourcol/NeuroM

def test_has_no_flat_neurites():

    _, n = _load_neuron('Neuron.swc')

    nt.assert_true(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance'))
    nt.assert_true(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio'))

    n = _make_flat(n)

    nt.assert_false(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance'))
    nt.assert_false(nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio'))

コード例 #3

def test_has_no_flat_neurites():

    _, n = _load_neuron('Neuron.swc')

    assert nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance')
    assert nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio')

    n = _make_flat(n)

    assert not nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 1e-6, method='tolerance')
    assert not nrn_chk.has_no_flat_neurites(n, 0.1, method='ratio')

コード例 #4

ファイル: benchmarks.py プロジェクト: BlueBrain/NeuroM

 def time_has_no_flat_neurites(self):
     nc.has_no_flat_neurites(self.neuron, tol=0.1, method='ratio')

コード例 #5

ファイル: benchmarks.py プロジェクト: yamagatm/NeuroM

 def time_has_no_flat_neurites(self):
     nc.has_no_flat_neurites(self.neuron, tol=0.1, method='ratio')