コード例 #1
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ファイル: test_auto_ConvertWarp.py プロジェクト: cdla/nipype
def test_ConvertWarp_inputs():
    input_map = dict(abswarp=dict(argstr='--abs',
    xor=['relwarp'],
    ),
    args=dict(argstr='%s',
    ),
    cons_jacobian=dict(argstr='--constrainj',
    ),
    environ=dict(nohash=True,
    usedefault=True,
    ),
    ignore_exception=dict(nohash=True,
    usedefault=True,
    ),
    jacobian_max=dict(argstr='--jmax=%f',
    ),
    jacobian_min=dict(argstr='--jmin=%f',
    ),
    out_abswarp=dict(argstr='--absout',
    xor=['out_relwarp'],
    ),
    out_file=dict(argstr='--out=%s',
    name_source=['reference'],
    name_template='%s_concatwarp',
    output_name='out_file',
    position=-1,
    ),
    out_relwarp=dict(argstr='--relout',
    xor=['out_abswarp'],
    ),
    output_type=dict(),
    postmat=dict(argstr='--postmat=%s',
    ),
    premat=dict(argstr='--premat=%s',
    ),
    reference=dict(argstr='--ref=%s',
    mandatory=True,
    position=1,
    ),
    relwarp=dict(argstr='--rel',
    xor=['abswarp'],
    ),
    shift_direction=dict(argstr='--shiftdir=%s',
    requires=['shift_in_file'],
    ),
    shift_in_file=dict(argstr='--shiftmap=%s',
    ),
    terminal_output=dict(mandatory=True,
    nohash=True,
    ),
    warp1=dict(argstr='--warp1=%s',
    ),
    warp2=dict(argstr='--warp2=%s',
    ),
    )
    inputs = ConvertWarp.input_spec()

    for key, metadata in input_map.items():
        for metakey, value in metadata.items():
            yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
コード例 #2
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def test_ConvertWarp_outputs():
    output_map = dict(out_file=dict(), )
    outputs = ConvertWarp.output_spec()

    for key, metadata in output_map.items():
        for metakey, value in metadata.items():
            yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
コード例 #3
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def test_ConvertWarp_inputs():
    input_map = dict(
        abswarp=dict(
            argstr='--abs',
            xor=['relwarp'],
        ),
        args=dict(argstr='%s', ),
        cons_jacobian=dict(argstr='--constrainj', ),
        environ=dict(
            nohash=True,
            usedefault=True,
        ),
        ignore_exception=dict(
            nohash=True,
            usedefault=True,
        ),
        jacobian_max=dict(argstr='--jmax=%f', ),
        jacobian_min=dict(argstr='--jmin=%f', ),
        midmat=dict(argstr='--midmat=%s', ),
        out_abswarp=dict(
            argstr='--absout',
            xor=['out_relwarp'],
        ),
        out_file=dict(
            argstr='--out=%s',
            name_source=['reference'],
            name_template='%s_concatwarp',
            output_name='out_file',
            position=-1,
        ),
        out_relwarp=dict(
            argstr='--relout',
            xor=['out_abswarp'],
        ),
        output_type=dict(),
        postmat=dict(argstr='--postmat=%s', ),
        premat=dict(argstr='--premat=%s', ),
        reference=dict(
            argstr='--ref=%s',
            mandatory=True,
            position=1,
        ),
        relwarp=dict(
            argstr='--rel',
            xor=['abswarp'],
        ),
        shift_direction=dict(
            argstr='--shiftdir=%s',
            requires=['shift_in_file'],
        ),
        shift_in_file=dict(argstr='--shiftmap=%s', ),
        terminal_output=dict(nohash=True, ),
        warp1=dict(argstr='--warp1=%s', ),
        warp2=dict(argstr='--warp2=%s', ),
    )
    inputs = ConvertWarp.input_spec()

    for key, metadata in input_map.items():
        for metakey, value in metadata.items():
            yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
コード例 #4
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def test_ConvertWarp_outputs():
    output_map = dict(out_file=dict(),
    )
    outputs = ConvertWarp.output_spec()

    for key, metadata in output_map.items():
        for metakey, value in metadata.items():
            yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value