コード例 #1
0
ファイル: nh2.py プロジェクト: horta/limix-tool
def E_tl2_cdf(varg, vare, o):
    g_mu = 0
    # vg = np.sqrt(varg)
    ve = np.sqrt(vare)
    b = ve * np.sqrt(1 + varg / vare)
    c = o / b
    #_tl2_g_mu = 2*g_mu*E_tl_cdf(varg, vare, o)
    _tl2_g_mu = cdf(c) * (varg - g_mu * g_mu)
    _tl2_g_mu -= varg * varg * c * pdf(c) / (vare + varg)
    return _tl2_g_mu
コード例 #2
0
ファイル: nh2.py プロジェクト: horta/limix-tool
 def fun2(tg):
     return tg * E_tl_e_trunc_lower(tg, vare, o) * pdf(tg, g_mu, varg)
コード例 #3
0
ファイル: nh2.py プロジェクト: horta/limix-tool
 def fun1(tg):
     return tg * E_tl_e_trunc_upper(tg, vare, o) * pdf(tg, g_mu, varg)
コード例 #4
0
ファイル: nh2.py プロジェクト: horta/limix-tool
def E_tl_cdf(varg, vare, o):
    # vg = np.sqrt(varg)
    ve = np.sqrt(vare)
    b = ve * np.sqrt(1 + varg / vare)
    return -varg * pdf(o / b) / b
コード例 #5
0
ファイル: heritability.py プロジェクト: horta/limix-tool
def _lambda_alpha(alpha):
    return pdf(alpha) / (1 - cdf(alpha))