コード例 #1
0
ファイル: test.py プロジェクト: rebeldroid12/pyinseq 
 def test_csv_read_headers(self):
     self.assertEqual(
         read_data(self.data)[0],
         [
             "Contig",
             "Start",
             "End",
             "Strand",
             "Length",
             "PID",
             "Gene",
             "Synonym",
             "Code",
             "COG",
             "Product",
             "E001_01",
             "E001_02",
         ],
     )
コード例 #2
0
ファイル: test.py プロジェクト: rebeldroid12/pyinseq 
 def test_csv_row_without_transposon_hits(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[19][6], "tusA")
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[19][11]), 0)
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[19][12]), 0)
コード例 #3
0
ファイル: test.py プロジェクト: rebeldroid12/pyinseq 
 def test_csv_row_with_transposon_hits(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[12][6], "gyrB")
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[12][11]), 1e5)
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[12][12]), 1e5)
コード例 #4
0
 def test_csv_read_data_headers(self):
     self.assertEqual(
         read_data(self.data)[0], [
             'County', '% Rural', '% Urban', 'Rural', 'Urban', 'Total',
             'Location 1'
         ])
コード例 #5
0
 def test_csv_read_data_points(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][2], 'average')
コード例 #6
0
 def test_csv_read_data_total_population(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][5], '555561')
コード例 #7
0
    def test_get_max_temp(self):

        self.assertEqual(get_max_temp_difference(read_data(self.data)), 45)
コード例 #8
0
 def test_csv_read_data_points(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][7], '87')
コード例 #9
0
 def test_data(self):
     read_data(self.data)
コード例 #10
0
 def test_read_value(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[2][0], '3')
コード例 #11
0
 def test_csv_read_data_total_population(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][5], '555561')
コード例 #12
0
 def test_csv_read_data_county_name(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][0], 'Baringo')
コード例 #13
0
 def test_csv_read_data_headers(self):
     self.assertEqual(
         read_data(self.data)[0],
             ['County','% Rural','% Urban','Rural','Urban','Total','Location 1']
     )
コード例 #14
0
ファイル: test.py プロジェクト: rebeldroid12/pyinseq 
 def test_csv_different_barcodes(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[34][6], "thiE")
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[34][11]), 5e4)
     self.assertEqual(float(read_data(self.data)[34][12]), 1e5)
コード例 #15
0
    def test_print_results(self):

        print("Day " + str(get_index(read_data(self.data)) + 3))
        print("Maximum Spread " +
              str(get_max_temp_difference(read_data(self.data))))
コード例 #16
0
 def test_csv_read_data_team_name(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][0], 'Arsenal')
コード例 #17
0
 def test_csv_read_data_county_name(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[1][0], 'Baringo')
コード例 #18
0
 def test_csv_read_data_headers(self):
     self.assertEqual(
         read_data(self.data)[0], [
             'Team', 'Games', 'Wins', 'Losses', 'Draws', 'Goals',
             'Goals Allowed', 'Points'
         ])
コード例 #19
0
 def test_csv_read_data_headers(self):
     self.assertEqual(read_data(self.data)[0], ['Time', 'Usage', 'Label'])