Python create_waterの例

コード例 #1

ファイル: test_aamindist.py プロジェクト: borislavujo/pele

    def setUp(self):
        #GMIN.initialize()
#        self.pot = GMINPotential(GMIN)
        self.nrigid = 10
        self.water = create_water()
        self.topology = RBTopology()
        self.topology.add_sites([deepcopy(self.water) for i in xrange(self.nrigid)])    

コード例 #2

ファイル: test_aamindist.py プロジェクト: cjforman/pele

    def setUp(self):
        #GMIN.initialize()
#        self.pot = GMINPotential(GMIN)
        self.nrigid = 10
        self.water = create_water()
        self.topology = RBTopology()
        self.topology.add_sites([deepcopy(self.water) for _ in xrange(self.nrigid)])
        self.topology.finalize_setup()

コード例 #3

ファイル: test_aamindist.py プロジェクト: pele-python/pele

 def setUp(self):
     self.nrigid = 10
     self.topology = RBTopology()
     self.topology.add_sites([create_water() for _ in range(self.nrigid)])
     self.topology.finalize_setup()
     self.transform = TransformAngleAxisCluster(self.topology)

コード例 #4

 def setUp(self):
     self.nrigid = 10
     self.topology = RBTopology()
     self.topology.add_sites([create_water() for _ in range(self.nrigid)])
     self.topology.finalize_setup()
     self.transform = TransformAngleAxisCluster(self.topology)