Python MetadataUtilsの例

コード例 #1

ファイル: test_pipeline.py プロジェクト: MBL-Woods-Hole/py_mbl_sequencing_pipeline

 def setUpReverse(self):
     self.configPath = "test/data/trim_test_reverse.ini"
     m=MetadataUtils(self)
     config_dict = m.create_dictionary_from_ini()
     self.run = Run(config_dict, self, self.baseoutputdir)
     process(self.run,"trim")
     self.expected = self.get_expected_results('test/data/test_trim_reverse.results')

コード例 #2

ファイル: test_pipeline.py プロジェクト: avoorhis/py_mbl_sequencing_pipeline

 def setUpReverse(self):
     self.configPath = "test/data/trim_test_reverse.ini"
     m = MetadataUtils(self)
     config_dict = m.create_dictionary_from_ini()
     self.run = Run(config_dict, self, self.baseoutputdir)
     process(self.run, "trim")
     self.expected = self.get_expected_results(
         'test/data/test_trim_reverse.results')

コード例 #3

ファイル: test_pipeline.py プロジェクト: MBL-Woods-Hole/py_mbl_sequencing_pipeline

 def setUpForward(self):
     self.configPath = "test/data/trim_test_forward.ini"
     m=MetadataUtils(self)
     config_dict = m.create_dictionary_from_ini()
     print 'configDict',config_dict
     self.run = Run(config_dict, self, self.baseoutputdir)
     process(self.run,"trim")
     self.expected = self.get_expected_results('test/data/test_trim_forward.results')

コード例 #4

ファイル: test_pipeline.py プロジェクト: avoorhis/py_mbl_sequencing_pipeline

 def setUpForward(self):
     self.configPath = "test/data/trim_test_forward.ini"
     m = MetadataUtils(self)
     config_dict = m.create_dictionary_from_ini()
     print 'configDict', config_dict
     self.run = Run(config_dict, self, self.baseoutputdir)
     process(self.run, "trim")
     self.expected = self.get_expected_results(
         'test/data/test_trim_forward.results')