Python ChromosomeTemplate.closest_markerの例

コード例 #1

ファイル: test_chromosometemplate.py プロジェクト: jameshicks/pydigree

def test_chromosometemplate():
	# Test the marker finder
	c = ChromosomeTemplate()
	for i in range(1,100):
		c.add_genotype(map_position=i, bp=(i*1e6))

	assert c.closest_marker(0) == 0
	assert c.closest_marker(5000001) == 4
	assert c.closest_marker(5999999) == 5
	assert c.closest_marker(1e10) == c.nmark() - 1 

コード例 #2

def test_chromosometemplate():
    # Test the marker finder
    c = ChromosomeTemplate()
    for i in range(1, 100):
        c.add_genotype(map_position=i, bp=(i * 1e6))

    assert c.closest_marker(0) == 0
    assert c.closest_marker(5000001) == 4
    assert c.closest_marker(5999999) == 5
    assert c.closest_marker(1e10) == c.nmark() - 1