コード例 #1
0
ファイル: test_molecule.py プロジェクト: ycarissan/PyGauss 
 def setUp(self):
     self.mol1 = pg.Molecule(folder_obj=pg.get_test_folder(),
                       opt_fname='CJS1_emim-cl_F_6-311+g-d-p-_gd3bj_opt-modredundant_unfrz.log',
                       atom_groups={'emim':range(1,20), 'cl':[20]},
                       alignto=[3,2,1])
     self.mol2 = pg.Molecule(folder_obj=pg.get_test_folder(),
                       opt_fname='CJS1_emim-cl_F_6-311+g-d-p-_gd3bj_opt-modredundant_unfrz.log',
                       atom_groups={'emim':range(1,20), 'cl':[20]},
                       alignto=[3,2,1])
コード例 #2
0
ファイル: test_molecule.py プロジェクト: Python3pkg/PyGauss 
 def setUp(self):
     self.mol = pg.Molecule(
         folder_obj=pg.get_test_folder(),
         init_fname='CJS1_emim-cl_B_init.com',
         opt_fname=
         'CJS1_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_opt-modredundant_unfrz.log',
         nbo_fname=
         'CJS1_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_pop-nbo-full-_unfrz.log')
コード例 #3
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ファイル: test_molecule.py プロジェクト: Python3pkg/PyGauss 
 def test_wildcard_fname(self):
     fnames = {
         'init_fname': '*_emim-cl_B_init.com',
         'opt_fname':
         '*_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_opt-modredundant_unfrz.log',
         'freq_fname': '*_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_freq_unfrz.log',
         'nbo_fname':
         '*_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_pop-nbo-full-_unfrz.log'
     }
     pg.Molecule(folder_obj=self.folder, **fnames)
コード例 #4
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ファイル: test_molecule.py プロジェクト: Python3pkg/PyGauss 
 def setUp(self):
     self.mol = pg.Molecule(
         folder_obj=pg.get_test_folder(),
         opt_fname=
         'CJS1_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_opt-modredundant_unfrz.log')
コード例 #5
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ファイル: test_molecule.py プロジェクト: Python3pkg/PyGauss 
 def setUp(self):
     self.mol = pg.Molecule(folder_obj=pg.get_test_folder(),
                            nbo_fname='test_3h2o_pop.log')
コード例 #6
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ファイル: test_molecule.py プロジェクト: Python3pkg/PyGauss 
 def setUp(self):
     self.mol = pg.Molecule(
         folder_obj=pg.get_test_folder(),
         freq_fname='CJS1_emim-cl_B_6-311+g-d-p-_gd3bj_freq_unfrz.log')