Python cluster_by_connectivityの例

コード例 #1

ファイル: old.py プロジェクト: malei-pku/navis

    def test_clustresults(self):
        res = pymaid.cluster_by_connectivity(config_test.test_skids)

        self.assertIsNotNone(res.linkage, np.ndarray)
        self.assertIsNotNone(res.leafs)
        self.assertIsNotNone(res.cophenet)
        self.assertIsNotNone(res.agg_coeff)
        res.to_selection()
        self.assertIsInstance(res.get_colormap(k=2), dict)
        self.assertIsInstance(res.get_clusters(k=2), list)

コード例 #2

ファイル: old.py プロジェクト: malei-pku/navis

 def test_connectivity_cluster(self):
     self.assertIsInstance(pymaid.cluster_by_connectivity(config_test.test_skids),
                           pymaid.ClustResults)