コード例 #1
0
ファイル: pmg_example.py プロジェクト: czhengsci/tscccommand 
def generate_diffraction_plot(args):
    s = Structure.from_file(args.filenames[0])
    c = XRDCalculator()
    if args.outfile:
        c.get_xrd_plot(s).savefig(args.outfile[0])
    else:
        c.show_xrd_plot(s)
コード例 #2
0
ファイル: pmg.py プロジェクト: cespejo79/pymatgen 
def generate_diffraction_plot(args):
    s = Structure.from_file(args.filenames[0])
    c = XRDCalculator()
    if args.outfile:
        c.get_xrd_plot(s).savefig(args.outfile[0])
    else:
        c.show_xrd_plot(s)
コード例 #3
0
    def calculate(self, structure, show=False):

        c = XRDCalculator(wavelength=self.wavelength)
        xrd_pattern = c.get_xrd_pattern(AseAtomsAdaptor.get_structure(structure))

        if show:
            c.show_xrd_plot(AseAtomsAdaptor.get_structure(structure))

        descriptor_data = dict(descriptor_name=self.name, descriptor_info=str(self), xrd_pattern=xrd_pattern)

        structure.info['descriptor'] = descriptor_data

        return structure
コード例 #4
0
from pymatgen.io.vaspio import Vasprun

vr=Vasprun("vasprun.xml")

structure0=vr.structures[0]
structure1=vr.structures[391]

from pymatgen.analysis.diffraction.xrd import XRDCalculator

c = XRDCalculator()

c.show_xrd_plot(structure0)
c.show_xrd_plot(structure1)