Python IndexedMzMLFileの例

コード例 #1

ファイル: test_FileIO.py プロジェクト: trofimovamw/OpenMS

    def test_readfile_content(self):
        f = pyopenms.IndexedMzMLFile()
        f.openFile(self.filename)

        self.assertEqual(f.getNrSpectra(), 2)
        self.assertEqual(f.getNrChromatograms(), 1)

        s = f.getSpectrumById(0)
        mzdata = s.getMZArray()
        intdata = s.getIntensityArray()
        self.assertEqual(len(mzdata), 19914)
        self.assertEqual(len(intdata), 19914)

コード例 #2

ファイル: test_FileIO.py プロジェクト: trofimovamw/OpenMS

    def test_readfile(self):
        f = pyopenms.IndexedMzMLFile()
        f.openFile(self.filename)

        self.assertTrue(f.getParsingSuccess())