コード例 #1
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__triploid():
    count_gc_diploid("B")
コード例 #2
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_dipoid__ambigious():
    assert_equal(count_gc_diploid("ACGGNTATCA"), (8, 18))
コード例 #3
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__ambigous_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("AcGGntAtcA"), (8, 18))
コード例 #4
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__complex():
    assert_equal(count_gc_diploid("RTGTKMGTCA"), (9, 20))
コード例 #5
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__complex_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("rtGTKMgTcA"), (9, 20))
コード例 #6
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__simple():
    assert_equal(count_gc_diploid("ACGGGTATCA"), (10, 20))
コード例 #7
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__simple_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("AcGGgtAtcA"), (10, 20))
コード例 #8
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__triploid():
    count_gc_diploid("B")
コード例 #9
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: schae234/pypeline
def test_count_gc_diploid__empty_string():
    assert_equal(count_gc_diploid(""), (0, 0))
コード例 #10
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_dipoid__ambigious():
    assert_equal(count_gc_diploid("ACGGNTATCA"), (8, 18))
コード例 #11
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__ambigous_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("AcGGntAtcA"), (8, 18))
コード例 #12
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__complex_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("rtGTKMgTcA"), (9, 20))
コード例 #13
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__complex():
    assert_equal(count_gc_diploid("RTGTKMGTCA"), (9, 20))
コード例 #14
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__simple_mixed_case():
    assert_equal(count_gc_diploid("AcGGgtAtcA"), (10, 20))
コード例 #15
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__simple():
    assert_equal(count_gc_diploid("ACGGGTATCA"), (10, 20))
コード例 #16
0
ファイル: sequences_test.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def test_count_gc_diploid__empty_string():
    assert_equal(count_gc_diploid(""), (0, 0))