コード例 #1
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ファイル: paleomix.py プロジェクト: UMNPonyClub/paleomix
    def _run(self, _config, temp):
        table = {}
        for filename in self.input_files:
            coverage.read_table(table, filename)

        coverage.write_table(table, reroot_path(temp, self._output_file))
        move_file(reroot_path(temp, self._output_file), self._output_file)
コード例 #2
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ファイル: paleomix.py プロジェクト: health1987/paleomix
    def _run(self, _config, temp):
        table = {}
        for filename in self.input_files:
            coverage.read_table(table, filename)

        coverage.write_table(table, reroot_path(temp, self._output_file))
        move_file(reroot_path(temp, self._output_file), self._output_file)
コード例 #3
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ファイル: coverage.py プロジェクト: KHanghoj/epiPALEOMIX
def print_table(args, handle, counts):
    table = build_table(args, handle, counts)
    write_table(table, args.outfile)
コード例 #4
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ファイル: coverage.py プロジェクト: CarlesV/paleomix
def print_table(args, handle, counts):
    table = build_table(args, handle, counts)
    write_table(table, args.outfile)