Python star_alignment_runの例

コード例 #1

ファイル: star_multilane_pe.py プロジェクト: gaberosser/qmul-bioinf

#!/usr/bin/env python
import os
import argparse
import sys
import math

# add root of project dir to the path
sys.path.append(os.path.dirname(__file__) + '/../../')
from pyscript import star

if __name__ == "__main__":
    star.star_alignment_run("pe_multilane_bash")

コード例 #2

#!/usr/bin/env python
import os
import argparse
import sys
import math

# add root of project dir to the path
sys.path.append(os.path.dirname(__file__) + '/../../')
from pyscript import star

if __name__ == "__main__":
    star.star_alignment_run("pe_encode_bash")

コード例 #3

ファイル: star_se.py プロジェクト: gaberosser/qmul-bioinf

#!/usr/bin/env python
import os
import argparse
import sys
import math

# add root of project dir to the path
sys.path.append(os.path.dirname(__file__) + '/../../')
from pyscript import star

if __name__ == "__main__":
    star.star_alignment_run("se_bash")

コード例 #4

ファイル: star_multilane_pe.py プロジェクト: gaberosser/qmul-bioinf

#!/usr/bin/env python
import os
import argparse
import sys
import math

# add root of project dir to the path
sys.path.append(os.path.dirname(__file__) + '/../../')
from pyscript import star

if __name__ == "__main__":
    star.star_alignment_run("pe_multilane_apocrita")

コード例 #5

#!/usr/bin/env python
import os
import argparse
import sys
import math

# add root of project dir to the path
sys.path.append(os.path.dirname(__file__) + '/../../')
from pyscript import star

if __name__ == "__main__":
    star.star_alignment_run("se_apocrita")