コード例 #1
0
ファイル: relatedness.py プロジェクト: QinLab/MAPGD 
def FullModel(params):
	e, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2=params
	rml.fullModel(e, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
	return (-rml.get_ll() )
コード例 #2
0
ファイル: relatedness.py プロジェクト: QinLab/MAPGD 
def Model_hess(params):
	fA, fC, r, sA, sC, z1, z2=params
	rml.fullModel(0, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
	return ( np.multiply( np.array(rml.get_hess()).reshape(7,7), 1) )
コード例 #3
0
ファイル: relatedness.py プロジェクト: QinLab/MAPGD 
def Model_jac(params):
	fA, fC, r, sA, sC, z1, z2=params
	rml.fullModel(0, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
	return (np.multiply( rml.get_jac(), 1) )
コード例 #4
0
def FullModel(params):
    e, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2 = params
    rml.fullModel(e, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
    return (-rml.get_ll())
コード例 #5
0
def Model_hess(params):
    fA, fC, r, sA, sC, z1, z2 = params
    rml.fullModel(0, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
    return (np.multiply(np.array(rml.get_hess()).reshape(7, 7), 1))
コード例 #6
0
def Model_jac(params):
    fA, fC, r, sA, sC, z1, z2 = params
    rml.fullModel(0, fA, fC, r, sA, sC, z1, z2)
    return (np.multiply(rml.get_jac(), 1))