Python _parse_sampleinfoの例

コード例 #1

ファイル: test_input.py プロジェクト: jfear/snakemakelib-core

 def test_parse_sampleinfo_wrong_samplecolumn(self):
     samples = _parse_sampleinfo(sampleinfo=csv.DictReader(['Sample\n', 'Sample1\n', 'Sample2\n']),
                                sample_column_map={'SMM': 'SM', 'Platform': 'PL'})
     assert samples == [{'Sample':'Sample1'}, {'Sample':'Sample2'}]

コード例 #2

ファイル: test_input.py プロジェクト: jfear/snakemakelib-core

 def test_parse_sampleinfo(self):
     samples = _parse_sampleinfo(sampleinfo=csv.DictReader(['SM\n', 'Sample1\n', 'Sample2\n']))
     assert samples == [{'SM':'Sample1'}, {'SM':'Sample2'}]