コード例 #1
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ファイル: util.py プロジェクト: sarafina325/tardis
def parse_abundance_dict_to_dataframe(abundance_dict):
    atomic_number_dict = dict([(element_symbol2atomic_number(symbol), abundance_dict[symbol])
                                   for symbol in abundance_dict])
    atomic_numbers = sorted(atomic_number_dict.keys())

    abundances = pd.Series([atomic_number_dict[z] for z in atomic_numbers], index=atomic_numbers)

    abundance_norm = abundances.sum()
    if abs(abundance_norm - 1) > 1e-12:
        logger.warning('Given abundances don\'t add up to 1 (value = %g) - normalizing', abundance_norm)
        abundances /= abundance_norm

    return abundances
コード例 #2
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ファイル: util.py プロジェクト: rcthomas/tardis
def parse_abundance_dict_to_dataframe(abundance_dict):
    atomic_number_dict = dict([(element_symbol2atomic_number(symbol), abundance_dict[symbol])
                                   for symbol in abundance_dict])
    atomic_numbers = sorted(atomic_number_dict.keys())

    abundances = pd.Series([atomic_number_dict[z] for z in atomic_numbers], index=atomic_numbers)

    abundance_norm = abundances.sum()
    if abs(abundance_norm - 1) > 1e-12:
        logger.warn('Given abundances don\'t add up to 1 (value = %g) - normalizing', abundance_norm)
        abundances /= abundance_norm

    return abundances
コード例 #3
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ファイル: test_util.py プロジェクト: zdy0903/tardis
def test_element_symbol2atomic_number(element_symbol, atomic_number):
    assert element_symbol2atomic_number(element_symbol) == atomic_number

    with pytest.raises(MalformedElementSymbolError):
        element_symbol2atomic_number('Hx')
コード例 #4
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ファイル: test_util.py プロジェクト: tardis-sn/tardis
def test_element_symbol2atomic_number(element_symbol, atomic_number):
    assert element_symbol2atomic_number(element_symbol) == atomic_number

    with pytest.raises(MalformedElementSymbolError):
        element_symbol2atomic_number('Hx')