Python Tree.derootの例

コード例 #1

ファイル: tasks.py プロジェクト: xypan1232/treeCl

def minsq_task(dv, gm, lab, tree, niters=10):
    tree, sse = tree_collection.compute(dv, gm, lab, tree, niters, False, True)
    tree = Tree(tree)
    tree.deroot()
    return dict(tree=tree.newick, sse=sse)

コード例 #2

ファイル: tasks.py プロジェクト: xypan1232/treeCl

def minsq_task(dv, gm, lab, tree, niters=10):
    tree, sse = tree_collection.compute(dv, gm, lab, tree, niters, False, True)
    tree = Tree(tree)
    tree.deroot()
    return dict(tree=tree.newick, sse=sse)