Python calc_min_maxの例

コード例 #1

ファイル: test_matrix.py プロジェクト: JoseBlanca/variation

 def test_min_max(self):
     mat = numpy.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
     assert calc_min_max(mat) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, chunk_size=1) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, chunk_size=None) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, sample_idx=1) == (2, 5)
     assert calc_min_max(mat, sample_idx=1, chunk_size=None) == (2, 5)

コード例 #2

 def test_min_max(self):
     mat = numpy.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
     assert calc_min_max(mat) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, chunk_size=1) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, chunk_size=None) == (1, 6)
     assert calc_min_max(mat, sample_idx=1) == (2, 5)
     assert calc_min_max(mat, sample_idx=1, chunk_size=None) == (2, 5)

コード例 #3

def histograma_min_max_prueba():
    fpath = join(TEST_DATA_DIR, 'performance', 'inca_torvum_all_snps.h5')
    h5 = VariationsH5(fpath, mode='r')
    _, _ = calc_min_max(h5['/calls/GT'])

コード例 #4

ファイル: performance.py プロジェクト: JoseBlanca/variation

def histograma_min_max_prueba():
    fpath = join(TEST_DATA_DIR, 'performance', 'inca_torvum_all_snps.h5')
    h5 = VariationsH5(fpath, mode='r')
    _, _ = calc_min_max(h5['/calls/GT'])