def cells_standard_space_cli_parser():
parser = ArgumentParser(formatter_class=ArgumentDefaultsHelpFormatter)
parser = cli_parse(parser)
parser = cellfinder_parse.pixel_parser(parser)
parser = cellfinder_parse.standard_space_parse(parser)
parser = cellfinder_parse.misc_parse(parser)
parser = geometry_parser(parser)
parser = registration_parse(parser)
return parser
def cellfinder_parser():
parser = ArgumentParser(formatter_class=ArgumentDefaultsHelpFormatter)
parser = main_parse(parser)
parser = registration_parse(parser)
parser = atlas_parse(parser)
parser = pixel_parser(parser)
parser = geometry_parser(parser)
parser = cellfinder_opt_parse(parser)
parser = io_parse(parser)
parser = cell_detect_parse(parser)
parser = classification_parse(parser)
parser = cube_extract_parse(parser)
parser = count_summary_parse(parser)
parser = figures_parse(parser)
parser = amap_vis_parser(parser)
parser = standard_space_parse(parser)
parser = misc_parse(parser)
parser = amap_parser(parser)
parser = model_parser(parser)
parser = download_directory_parser(parser)
return parser