예제 #1
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    def test_align_flat_rmsd(self):
        for cout in xrange(20):
            x = perturb(randomize_mol(methane))
            y = perturb(randomize_mol(methane))
            y = x.copy()

            aligned_y = cm.align(x.copy(), y.copy())

            self.assertAlmostEqual(cm.rmsd(x, y), cm.flat_rmsd(x, aligned_y), 5)
예제 #2
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파일: gnat.py 프로젝트: plediii/coord_util 
 def dist(self, x, y):
     return coord_math.rmsd(x, y)
예제 #3
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 def dist(self, x, y):
     self.counter += 1
     return coord_math.rmsd(x, y)