Python ClinVar 예제들

예제 #1

파일: test_clinvar.py 프로젝트: JervenBolleman/dipper

class ClinVarTestCase(SourceTestCase):

    def setUp(self):
        self.source = ClinVar()
        self.source.gene_ids = self._get_conf()['test_ids']['gene']
        self.source.disease_ids = self._get_conf()['test_ids']['disease']
        self.source.settestonly(True)
        self.source.setnobnodes(True)
        self._setDirToSource()
        return

    def tearDown(self):
        self.source = None
        return

예제 #2

파일: test_clinvar.py 프로젝트: JervenBolleman/dipper

 def setUp(self):
     self.source = ClinVar()
     self.source.gene_ids = self._get_conf()['test_ids']['gene']
     self.source.disease_ids = self._get_conf()['test_ids']['disease']
     self.source.settestonly(True)
     self.source.setnobnodes(True)
     self._setDirToSource()
     return