예제 #1
0
 def decoding(self):
     """
     描述: 种群染色体解码。
 """
 
     if self.Encoding == 'B' or self.Encoding == 'G': # 此时Field实际上为FieldD
         if self.conordis == 0:
             Phen = ga.bs2rv(self.Chrom, self.Field) # 解码
         elif self.conordis == 1:
             Phen = ga.bs2int(self.Chrom, self.Field)
         else:
             raise RuntimeError('error in Population.decoding: Conordis is illegal. (种群的conordis参数错误。)')
     else:
         Phen = self.Chrom.copy()
     return Phen
예제 #2
0
def sga_new_code_templet(AIM_M,
                         AIM_F,
                         PUN_M,
                         PUN_F,
                         FieldD,
                         problem,
                         maxormin,
                         MAXGEN,
                         NIND,
                         SUBPOP,
                         GGAP,
                         selectStyle,
                         recombinStyle,
                         recopt,
                         pm,
                         drawing=1):
    """
sga_new_code_templet.py - 改进的单目标编程模板(二进制/格雷编码)

本模板实现改进单目标编程模板(二进制/格雷编码),将父子两代合并进行选择,增加了精英保留机制

语法:
    该函数除了参数drawing外,不设置可缺省参数。当某个参数需要缺省时,在调用函数时传入None即可。
    比如当没有罚函数时,则在调用编程模板时将第3、4个参数设置为None即可,如:
    sga_new_code_templet(AIM_M, 'aimfuc', None, None, ..., maxormin)

输入参数:
    AIM_M - 目标函数的地址,传入该函数前通常由AIM_M = __import__('目标函数名')语句得到
    
    AIM_F : str - 目标函数名
    
    PUN_M - 罚函数的地址,传入该函数前通常由PUN_M = __import__('罚函数名')语句得到
    
    PUN_F : str - 罚函数名
    
    FieldD : array  - 二进制/格雷码种群区域描述器,描
        述种群每个个体的染色体长度和如何解码的矩阵,它有以下结构:
                    
        [lens;		(int) 每个控制变量编码后在染色体中所占的长度
         lb;		(float) 指明每个变量使用的下界
         ub;		(float) 指明每个变量使用的上界
         codes;	(0:binary     | 1:gray) 指明子串是怎么编码的,
                                          0为标准二进制编码,1为各类编码
         scales;  (0: rithmetic | 1:logarithmic) 指明每个子串是否使用对数或算术刻度, 
                                                 1为使用对数刻度,2为使用算术刻度
         lbin;		(0:excluded   | 1:included)
         ubin]		(0:excluded   | 1:included)
                
        lbin和ubin指明范围中是否包含每个边界。
        选择lbin=0或ubin=0,表示范围中不包含相应边界。
        选择lbin=1或ubin=1,表示范围中包含相应边界。
    
    problem : str - 表明是整数问题还是实数问题,'I'表示是整数问题,'R'表示是实数问题                 
    
    maxormin int - 最小最大化标记,1表示目标函数最小化;-1表示目标函数最大化
    
    MAXGEN : int - 最大遗传代数
    
    NIND : int - 种群规模,即种群中包含多少个个体
    
    SUBPOP : int - 子种群数量,即对一个种群划分多少个子种群
    
    GGAP : float - 代沟,本模板中该参数为无用参数,仅为了兼容同类的其他模板而设
    
    selectStyle : str - 指代所采用的低级选择算子的名称,如'rws'(轮盘赌选择算子)
    
    recombinStyle: str - 指代所采用的低级重组算子的名称,如'xovsp'(单点交叉)
    
    recopt : float - 交叉概率
    
    pm : float - 重组概率
    
    drawing : int - (可选参数),0表示不绘图,1表示绘制最终结果图。默认drawing为1

输出参数:
    pop_trace : array - 种群进化记录器(进化追踪器),
                        第0列记录着各代种群最优个体的目标函数值
                        第1列记录着各代种群的适应度均值
                        第2列记录着各代种群最优个体的适应度值
    
    var_trace : array - 变量记录器,记录着各代种群最优个体的变量值,每一列对应一个控制变量
    
    times     : float - 进化所用时间

"""
    """==========================初始化配置==========================="""
    GGAP = 0.5  # 因为父子合并后选择,因此要将代沟设为0.5以维持种群规模
    # 获取目标函数和罚函数
    aimfuc = getattr(AIM_M, AIM_F)  # 获得目标函数
    if PUN_F is not None:
        punishing = getattr(PUN_M, PUN_F)  # 获得罚函数
    NVAR = FieldD.shape[1]  # 得到控制变量的个数
    # 定义进化记录器,初始值为nan
    pop_trace = (np.zeros((MAXGEN, 2)) * np.nan)
    # 定义变量记录器,记录控制变量值,初始值为nan
    var_trace = (np.zeros((MAXGEN, NVAR)) * np.nan)
    """=========================开始遗传算法进化======================="""
    Lind = np.sum(FieldD[0, :])  # 种群染色体长度
    Chrom = ga.crtbp(NIND, Lind)  # 生成初始种
    start_time = time.time()  # 开始计时
    # 开始进化!!
    for gen in range(MAXGEN):
        # 进行遗传算子产生子代
        SelCh = ga.recombin(recombinStyle, Chrom, recopt, SUBPOP)  # 重组
        SelCh = ga.mutbin(SelCh, pm)  # 变异
        Chrom = np.vstack([Chrom, SelCh])  # 父子合并
        # 计算种群适应度
        if problem == 'R':
            variable = ga.bs2rv(Chrom, FieldD)  # 解码
        elif problem == 'I':
            if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
                variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('object')  # 解码
            else:
                variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('int64')
        ObjV = aimfuc(variable)  # 求后代的目标函数值
        pop_trace[gen, 0] = np.sum(ObjV) // ObjV.shape[0]  # 记录种群个体平均目标函数值
        if maxormin == 1:
            pop_trace[gen, 1] = np.min(ObjV)  # 记录当代目标函数的最优值
            var_trace[gen, :] = variable[np.argmin(ObjV), :]  # 记录当代最优的控制变量值
        elif maxormin == -1:
            pop_trace[gen, 1] = np.max(ObjV)
            var_trace[gen, :] = variable[np.argmax(ObjV), :]  # 记录当代最优的控制变量值
        # 最后对合并的种群进行适应度评价并选出一半个体留到下一代
        FitnV = ga.ranking(maxormin * ObjV, None, SUBPOP)
        if PUN_F is not None:
            FitnV = punishing(Chrom, FitnV)  # 调用罚函数
        Chrom = ga.selecting(selectStyle, Chrom, FitnV, GGAP, SUBPOP)  # 选择
    end_time = time.time()  # 结束计时

    # 绘图
    if drawing == 1:
        ga.trcplot(pop_trace, [['种群个体平均目标函数值', '种群最优个体目标函数值']])
    # 输出结果
    if maxormin == 1:
        best_gen = np.argmin(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        print('最优的目标函数值为:' + str(np.min(pop_trace[:, 1])))
    elif maxormin == -1:
        best_gen = np.argmax(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        print('最优的目标函数值为:' + str(np.max(pop_trace[:, 1])))
    print('最优的控制变量值为:')
    for i in range(NVAR):
        print(var_trace[best_gen, i])
    print('最优的一代是第' + str(best_gen + 1) + '代')
    times = end_time - start_time
    print('时间已过' + str(times) + '秒')
    # 返回进化记录器、变量记录器以及执行时间
    return [pop_trace, var_trace, times]
예제 #3
0
def sga_code_templet(AIM_M,
                     AIM_F,
                     PUN_M,
                     PUN_F,
                     FieldD,
                     problem,
                     maxormin,
                     MAXGEN,
                     NIND,
                     SUBPOP,
                     GGAP,
                     selectStyle,
                     recombinStyle,
                     recopt,
                     pm,
                     distribute,
                     drawing=1):
    """
sga_code_templet.py - 单目标编程模板(二进制/格雷编码)

语法:
    该函数除了参数drawing外,不设置可缺省参数。当某个参数需要缺省时,在调用函数时传入None即可。
    比如当没有罚函数时,则在调用编程模板时将第3、4个参数设置为None即可,如:
    sga_code_templet(AIM_M, 'aimfuc', None, None, ..., maxormin)

输入参数:
    AIM_M - 目标函数的地址,由AIM_M = __import__('目标函数所在文件名')语句得到
            目标函数规范定义:[f,LegV] = aimfuc(Phen,LegV)
            其中Phen是种群的表现型矩阵, LegV为种群的可行性列向量,f为种群的目标函数值矩阵
    
    AIM_F : str - 目标函数名
    
    PUN_M - 罚函数的地址,由PUN_M = __import__('罚函数所在文件名')语句得到
            罚函数规范定义: newFitnV = punishing(LegV, FitnV)
            其中LegV为种群的可行性列向量, FitnV为种群个体适应度列向量
            一般在罚函数中对LegV为0的个体进行适应度惩罚,返回修改后的适应度列向量newFitnV
    
    PUN_F : str - 罚函数名
    
    FieldD : array  - 二进制/格雷码种群区域描述器,
        描述种群每个个体的染色体长度和如何解码的矩阵,它有以下结构:
                    
        [lens;		(int) 每个控制变量编码后在染色体中所占的长度
         lb;		(float) 指明每个变量使用的下界
         ub;		(float) 指明每个变量使用的上界
         codes;	(0:binary     | 1:gray) 指明子串是怎么编码的,
                                          0为标准二进制编码,1为各类编码
         scales;  (0: rithmetic | 1:logarithmic) 指明每个子串是否使用对数或算术刻度, 
                                                 1为使用对数刻度,2为使用算术刻度
         lbin;		(0:excluded   | 1:included)
         ubin]		(0:excluded   | 1:included)
                
        lbin和ubin指明范围中是否包含每个边界。
        选择lbin=0或ubin=0,表示范围中不包含相应边界。
        选择lbin=1或ubin=1,表示范围中包含相应边界。
    
    problem : str - 表明是整数问题还是实数问题,'I'表示是整数问题,'R'表示是实数问题                 
    
    maxormin int - 最小最大化标记,1表示目标函数最小化;-1表示目标函数最大化
    
    MAXGEN : int - 最大遗传代数
    
    NIND : int - 种群规模,即种群中包含多少个个体
    
    SUBPOP : int - 子种群数量,即对一个种群划分多少个子种群
    
    GGAP : float - 代沟,表示子代与父代染色体及性状不相同的概率
    
    selectStyle : str - 指代所采用的低级选择算子的名称,如'rws'(轮盘赌选择算子)
    
    recombinStyle: str - 指代所采用的低级重组算子的名称,如'xovsp'(单点交叉)
    
    recopt : float - 交叉概率
    
    pm : float - 重组概率
    
    distribute : bool - 是否增强种群的分布性(可能会造成收敛慢)
    
    drawing : int - (可选参数),0表示不绘图,1表示绘制最终结果图。默认drawing为1

输出参数:
    pop_trace : array - 种群进化记录器(进化追踪器),
                        第0列记录着各代种群最优个体的目标函数值
                        第1列记录着各代种群的适应度均值
                        第2列记录着各代种群最优个体的适应度值
    
    var_trace : array - 变量记录器,记录着各代种群最优个体的变量值,每一列对应一个控制变量
    
    times     : float - 进化所用时间

模板使用注意:
    1.本模板调用的目标函数形如:[ObjV,LegV] = aimfuc(Phen,LegV), 
      其中Phen表示种群的表现型矩阵, LegV为种群的可行性列向量(详见Geatpy数据结构)
    2.本模板调用的罚函数形如: newFitnV = punishing(LegV, FitnV), 
      其中FitnV为用其他算法求得的适应度
    若不符合上述规范,则请修改算法模板或自定义新算法模板
    3.关于'maxormin': geatpy的内核函数全是遵循“最小化目标”的约定的,即目标函数值越小越好。
      当需要优化最大化的目标时,需要设置'maxormin'为-1。
      本算法模板是正确使用'maxormin'的典型范例,其具体用法如下:
      当调用的函数传入参数包含与“目标函数值矩阵”有关的参数(如ObjV,ObjVSel,NDSetObjV等)时,
      查看该函数的参考资料(可用'help'命令查看,也可到官网上查看相应的教程),
      里面若要求传入前对参数乘上'maxormin',则需要乘上。
      里面若要求对返回参数乘上'maxormin'进行还原,
      则调用函数返回得到的相应参数需要乘上'maxormin'进行还原,否则其正负号就会被改变。

"""

    #==========================初始化配置==========================="""
    # 获取目标函数和罚函数
    aimfuc = getattr(AIM_M, AIM_F)  # 获得目标函数
    if PUN_F is not None:
        punishing = getattr(PUN_M, PUN_F)  # 获得罚函数
    NVAR = FieldD.shape[1]  # 得到控制变量的个数
    # 定义进化记录器,初始值为nan
    pop_trace = (np.zeros((MAXGEN, 2)) * np.nan)
    # 定义变量记录器,记录控制变量值,初始值为nan
    var_trace = (np.zeros((MAXGEN, NVAR)) * np.nan)
    ax = None  # 存储上一帧图形
    """=========================开始遗传算法进化======================="""
    Lind = np.sum(FieldD[0, :])  # 种群染色体长度
    Chrom = ga.crtbp(NIND, Lind)  # 生成初始种群
    if problem == 'R':
        variable = ga.bs2rv(Chrom, FieldD)  # 解码
    elif problem == 'I':
        if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
            variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('object')  # 解码
        else:
            variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('int64')  # 解码
    LegV = np.ones((NIND, 1))  # 生成可行性列向量,元素为1表示对应个体是可行解,0表示非可行解
    [ObjV, LegV] = aimfuc(variable, LegV)  # 求种群的目标函数值
    gen = 0
    badCounter = 0  # 用于记录在“遗忘策略下”被忽略的代数
    # 开始进化!!
    start_time = time.time()  # 开始计时
    while gen < MAXGEN:
        if badCounter >= 10 * MAXGEN:  # 若多花了10倍的迭代次数仍没有可行解出现,则跳出
            break
        FitnV = ga.ranking(maxormin * ObjV, LegV, None, SUBPOP)
        if PUN_F is not None:
            FitnV = punishing(LegV, FitnV)  # 调用罚函数
        # 记录进化过程
        bestIdx = np.argmax(FitnV)  # 获取最优个体的下标
        if LegV[bestIdx] != 0:
            feasible = np.where(LegV != 0)[0]  # 排除非可行解
            pop_trace[gen, 0] = np.sum(
                ObjV[feasible]) / ObjV[feasible].shape[0]  # 记录种群个体平均目标函数值
            pop_trace[gen, 1] = ObjV[bestIdx]  # 记录当代目标函数的最优值
            var_trace[gen, :] = variable[bestIdx, :]  # 记录当代最优的控制变量值
            # 绘制动态图
            if drawing == 2:
                ax = ga.sgaplot(pop_trace[:, [1]], '种群最优个体目标函数值', False, ax,
                                gen)
            badCounter = 0  # badCounter计数器清零
        else:
            gen -= 1  # 忽略这一代(遗忘策略)
            badCounter += 1
        if distribute == True:  # 若要增强种群的分布性(可能会造成收敛慢)
            idx = np.argsort(ObjV[:, 0], 0)
            dis = np.diff(ObjV[idx, 0]) / (np.max(ObjV[idx, 0]) - np.min(
                ObjV[idx, 0]) + 1)  # 差分计算距离的修正偏移量
            dis = np.hstack([dis, dis[-1]])
            dis = dis + np.min(dis)  # 修正偏移量+最小量=修正绝对量
            FitnV[idx, 0] *= np.exp(dis)  # 根据相邻距离修改适应度,突出相邻距离大的个体,以增加种群的多样性
        # 进行遗传算子
        SelCh = ga.selecting(selectStyle, Chrom, FitnV, GGAP, SUBPOP)  # 选择
        SelCh = ga.recombin(recombinStyle, SelCh, recopt, SUBPOP)  # 对所选个体进行重组
        SelCh = ga.mutbin(SelCh, pm)  # 变异
        # 计算种群适应度
        if problem == 'R':
            variable = ga.bs2rv(SelCh, FieldD)  # 解码
        elif problem == 'I':
            if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
                variable = ga.bs2int(SelCh, FieldD).astype('object')  # 解码
            else:
                variable = ga.bs2int(SelCh, FieldD).astype('int64')
        LegVSel = np.ones((SelCh.shape[0], 1))  # 初始化育种种群的可行性列向量
        [ObjVSel, LegVSel] = aimfuc(variable, LegVSel)  # 求后代的目标函数值
        FitnVSel = ga.ranking(maxormin * ObjVSel, LegVSel, None,
                              SUBPOP)  # 计算育种种群的适应度
        if PUN_F is not None:
            FitnVSel = punishing(LegVSel, FitnVSel)  # 调用罚函数
        # 重插入
        [Chrom, ObjV, LegV] = ga.reins(Chrom, SelCh, SUBPOP, 1, 1, FitnV,
                                       FitnVSel, ObjV, ObjVSel, LegV, LegVSel)
        # 计算新一代种群的控制变量解码值
        if problem == 'R':
            variable = ga.bs2rv(Chrom, FieldD)  # 解码
        elif problem == 'I':
            if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
                variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('object')  # 解码
            else:
                variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('int64')
        gen += 1
    end_time = time.time()  # 结束计时
    times = end_time - start_time
    # 后处理进化记录器
    delIdx = np.where(np.isnan(pop_trace))[0]
    pop_trace = np.delete(pop_trace, delIdx, 0)
    var_trace = np.delete(var_trace, delIdx, 0)
    if pop_trace.shape[0] == 0:
        raise RuntimeError('error: no feasible solution. (有效进化代数为0,没找到可行解。)')
    # 绘图
    if drawing != 0:
        ga.trcplot(pop_trace, [['种群个体平均目标函数值', '种群最优个体目标函数值']])
    # 输出结果
    if maxormin == 1:
        best_gen = np.argmin(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        best_ObjV = np.min(pop_trace[:, 1])
    elif maxormin == -1:
        best_gen = np.argmax(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        best_ObjV = np.max(pop_trace[:, 1])
    print('最优的目标函数值为:%s' % (best_ObjV))
    print('最优的控制变量值为:')
    for i in range(NVAR):
        print(var_trace[best_gen, i])
    print('有效进化代数:%s' % (pop_trace.shape[0]))
    print('最优的一代是第 %s 代' % (best_gen + 1))
    print('时间已过 %s 秒' % (times))
    # 返回进化记录器、变量记录器以及执行时间
    return [pop_trace, var_trace, times]
예제 #4
0
NIND = 50  # 种群规模
MAXGEN = 10  # 最大遗传代数
GGAP = 0.8  # 代沟:子代与父代个体不相同的概率为0.8
selectStyle = 'sus'
# 遗传算法的选择方式设为"sus"——随机抽样选择
recombinStyle = 'xovdp'  # 遗传算法的重组方式,设为两点交叉
recopt = 0.9  # 交叉概率
pm = 0.1  # 变异概率
SUBPOP = 1  # 设置种群数为1
maxormin = -1  # 设置最大最小化目标标记为1,表示是最小化目标,-1则表示最大化目标
"""=========================开始遗传算法进化========================"""
FieldD = ga.crtfld(ranges, borders)  # 调用函数创建区域描述器
Lind = np.sum(FieldD[0, :])  # 计算编码后的染色体长度
print(FieldD)
Chrom = ga.crtbp(NIND, FieldD)  # 根据区域描述器生成二进制种群
Phen = ga.bs2int(Chrom, FieldD)  #对初始种群进行解码
LegV = np.ones((NIND, 1))  # 初始化种群的可行性列向量
[ObjV, LegV] = aimfuc(Phen, LegV)  # 计算初始种群个体的目标函数值
# 定义进化记录器,初始值为nan
pop_trace = (np.zeros((MAXGEN, 2)) * np.nan)
# 定义种群最优个体记录器,记录每一代最优个体的染色体,初始值为nan
ind_trace = (np.zeros((MAXGEN, Lind)) * np.nan)
# 开始进化!!
start_time = time.time()  # 开始计时
for gen in range(MAXGEN):
    FitnV = ga.ranking(maxormin * ObjV, LegV)  # 根据目标函数大小分配适应度值
    SelCh = ga.selecting(selectStyle, Chrom, FitnV, GGAP, SUBPOP)  # 选择
    SelCh = ga.recombin(recombinStyle, SelCh, recopt, SUBPOP)  #交叉
    SelCh = ga.mutbin(SelCh, pm)  # 二进制种群变异
    Phen = ga.bs2rv(SelCh, FieldD)  # 对育种种群进行解码(二进制转十进制)
    LegVSel = np.ones((SelCh.shape[0], 1))  # 初始化育种种群的可行性列向量
예제 #5
0
def sga_code_templet(AIM_M,
                     AIM_F,
                     PUN_M,
                     PUN_F,
                     FieldD,
                     problem,
                     maxormin,
                     MAXGEN,
                     NIND,
                     SUBPOP,
                     GGAP,
                     selectStyle,
                     recombinStyle,
                     recopt,
                     pm,
                     drawing=1):
    """
sga_code_templet.py - 单目标编程模板(二进制/格雷编码)

语法:
    该函数除了参数drawing外,不设置可缺省参数。当某个参数需要缺省时,在调用函数时传入None即可。
    比如当没有罚函数时,则在调用编程模板时将第3、4个参数设置为None即可,如:
    sga_code_templet(AIM_M, 'aimfuc', None, None, ..., maxormin)

输入参数:
    AIM_M - 目标函数的地址,由AIM_M = __import__('目标函数所在文件名')语句得到
            目标函数规范定义:f = aimfuc(Phen)
            其中Phen是种群的表现型矩阵
    
    AIM_F : str - 目标函数名
    
    PUN_M - 罚函数的地址,由PUN_M = __import__('罚函数所在文件名')语句得到
            罚函数规范定义: f = punishing(Phen, FitnV)
            其中Phen是种群的表现型矩阵, FitnV为种群个体适应度列向量
    
    PUN_F : str - 罚函数名
    
    FieldD : array  - 二进制/格雷码种群区域描述器,
        描述种群每个个体的染色体长度和如何解码的矩阵,它有以下结构:
                    
        [lens;		(int) 每个控制变量编码后在染色体中所占的长度
         lb;		(float) 指明每个变量使用的下界
         ub;		(float) 指明每个变量使用的上界
         codes;	(0:binary     | 1:gray) 指明子串是怎么编码的,
                                          0为标准二进制编码,1为各类编码
         scales;  (0: rithmetic | 1:logarithmic) 指明每个子串是否使用对数或算术刻度, 
                                                 1为使用对数刻度,2为使用算术刻度
         lbin;		(0:excluded   | 1:included)
         ubin]		(0:excluded   | 1:included)
                
        lbin和ubin指明范围中是否包含每个边界。
        选择lbin=0或ubin=0,表示范围中不包含相应边界。
        选择lbin=1或ubin=1,表示范围中包含相应边界。
    
    problem : str - 表明是整数问题还是实数问题,'I'表示是整数问题,'R'表示是实数问题                 
    
    maxormin int - 最小最大化标记,1表示目标函数最小化;-1表示目标函数最大化
    
    MAXGEN : int - 最大遗传代数
    
    NIND : int - 种群规模,即种群中包含多少个个体
    
    SUBPOP : int - 子种群数量,即对一个种群划分多少个子种群
    
    GGAP : float - 代沟,表示子代与父代染色体及性状不相同的概率
    
    selectStyle : str - 指代所采用的低级选择算子的名称,如'rws'(轮盘赌选择算子)
    
    recombinStyle: str - 指代所采用的低级重组算子的名称,如'xovsp'(单点交叉)
    
    recopt : float - 交叉概率
    
    pm : float - 重组概率
    
    drawing : int - (可选参数),0表示不绘图,1表示绘制最终结果图。默认drawing为1

输出参数:
    pop_trace : array - 种群进化记录器(进化追踪器),
                        第0列记录着各代种群最优个体的目标函数值
                        第1列记录着各代种群的适应度均值
                        第2列记录着各代种群最优个体的适应度值
    
    var_trace : array - 变量记录器,记录着各代种群最优个体的变量值,每一列对应一个控制变量
    
    times     : float - 进化所用时间

模板使用注意:
    1.本模板调用的目标函数形如:
        ObjV = aimfuc(Phen), 其中Phen表示种群的表现型矩阵
    2.本模板调用的罚函数形如: 
        [FitnV, punIdx] = punishing(Phen, FitnV), 
        其中输入参数的FitnV为惩罚前的适应度,输出参数的FitnV为惩罚后的适应度
        punIdx为惩罚的个体所在的下标
      在罚函数定义中,必须将不满足约束条件的个体对应的适应度设为0,否则请修改模板使用

"""

    #==========================初始化配置==========================="""
    # 获取目标函数和罚函数
    aimfuc = getattr(AIM_M, AIM_F)  # 获得目标函数
    if PUN_F is not None:
        punishing = getattr(PUN_M, PUN_F)  # 获得罚函数
    exIdx = np.array([])  # 存储非可行解的下标
    NVAR = FieldD.shape[1]  # 得到控制变量的个数
    # 定义进化记录器,初始值为nan
    pop_trace = (np.zeros((MAXGEN, 2)) * np.nan)
    # 定义变量记录器,记录控制变量值,初始值为nan
    var_trace = (np.zeros((MAXGEN, NVAR)) * np.nan)
    """=========================开始遗传算法进化======================="""
    Lind = np.sum(FieldD[0, :])  # 种群染色体长度
    Chrom = ga.crtbp(NIND, Lind)  # 生成初始种群
    if problem == 'R':
        variable = ga.bs2rv(Chrom, FieldD)  # 解码
    elif problem == 'I':
        if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
            variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('object')  # 解码
        else:
            variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('int64')  # 解码
    ObjV = aimfuc(variable)  # 求种群的目标函数值

    start_time = time.time()  # 开始计时
    # 开始进化!!
    for gen in range(MAXGEN):
        FitnV = ga.ranking(maxormin * ObjV, None, SUBPOP)
        if PUN_F is not None:
            [FitnV, exIdx] = punishing(Chrom, FitnV)  # 调用罚函数
        # 记录进化过程
        bestIdx = np.argmax(FitnV)  # 获取最优个体的下标
        wrongSign = np.ones((FitnV.shape[0], 1))
        wrongSign[list(exIdx)] = 0  # 对非可行解作标记
        if wrongSign[bestIdx] != 0:
            feasible = np.where(wrongSign != 0)[0]  # 排除非可行解
            pop_trace[gen, 0] = np.sum(
                ObjV[feasible]) / ObjV[feasible].shape[0]  # 记录种群个体平均目标函数值
            pop_trace[gen, 1] = ObjV[bestIdx]  # 记录当代目标函数的最优值
            var_trace[gen, :] = variable[bestIdx, :]  # 记录当代最优的控制变量值
        # 进行遗传算子
        SelCh = ga.selecting(selectStyle, Chrom, FitnV, GGAP, SUBPOP)  # 选择
        SelCh = ga.recombin(recombinStyle, Chrom, recopt, SUBPOP)  # 重组
        SelCh = ga.mutbin(SelCh, pm)  # 变异
        # 计算种群适应度
        if problem == 'R':
            variable = ga.bs2rv(SelCh, FieldD)  # 解码
        elif problem == 'I':
            if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
                variable = ga.bs2int(SelCh, FieldD).astype('object')  # 解码
            else:
                variable = ga.bs2int(SelCh, FieldD).astype('int64')
        ObjVSel = aimfuc(variable)  # 求后代的目标函数值
        # 重插入
        [Chrom, ObjV] = ga.reins(Chrom, SelCh, SUBPOP, 2, 1, ObjV, ObjVSel)
        # 计算新一代种群的控制变量解码值
        if problem == 'R':
            variable = ga.bs2rv(Chrom, FieldD)  # 解码
        elif problem == 'I':
            if np.any(FieldD >= sys.maxsize):
                variable = ga.bs2int(Chrom, FieldD).astype('object')  # 解码
            else:
                variable = ga.bs2int(SelCh, FieldD).astype('int64')
    end_time = time.time()  # 结束计时
    # 后处理进化记录器
    delIdx = np.where(np.isnan(pop_trace))[0]
    pop_trace = np.delete(pop_trace, delIdx, 0)
    var_trace = np.delete(var_trace, delIdx, 0)
    # 绘图
    if drawing == 1:
        ga.trcplot(pop_trace, [['种群个体平均目标函数值', '种群最优个体目标函数值']])
    # 输出结果
    if maxormin == 1:
        best_gen = np.argmin(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        print('最优的目标函数值为:', np.min(pop_trace[:, 1]))
    elif maxormin == -1:
        best_gen = np.argmax(pop_trace[:, 1])  # 记录最优种群是在哪一代
        print('最优的目标函数值为:', np.max(pop_trace[:, 1]))
    print('最优的控制变量值为:')
    for i in range(NVAR):
        print(var_trace[best_gen, i])
    print('最优的一代是第', best_gen + 1, '代')
    times = end_time - start_time
    print('时间已过', times, '秒')
    # 返回进化记录器、变量记录器以及执行时间
    return [pop_trace, var_trace, times]