예제 #1
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파일: test_mol2.py 프로젝트: hseara/mdtraj
def test_mol2_dataframe_status(get_fn):
    atoms, bonds = mol2.mol2_to_dataframes(get_fn('adp.mol2'))
    assert atoms['charge'][1] == 1.3672
    assert atoms['status'][1] == '****'
예제 #2
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def test_mol2_dataframe_status():
    atoms, bonds = mol2.mol2_to_dataframes(get_fn('adp.mol2'))
    assert atoms['charge'][1] == 1.3672
    assert atoms['status'][1] == '****'
예제 #3
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파일: test_mol2.py 프로젝트: hseara/mdtraj
def test_mol2_dataframe(get_fn):
    top, bonds = mol2.mol2_to_dataframes(get_fn("imatinib.mol2"))
    eq(top.name[2], "N1")
    eq(top.atype[2], "n3")
    eq(top.resName[2], "LIG")
    eq(float(top.charge[2]), -0.732600)
예제 #4
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def test_mol2_dataframe():
    top, bonds = mol2.mol2_to_dataframes(get_fn("imatinib.mol2"))
    eq(top.name[2], "N1")
    eq(top.atype[2], "n3")
    eq(top.resName[2], "LIG")
    eq(float(top.charge[2]), -0.732600)