def test_has_nonzero_soma_radius_threshold(): class Dummy(object): pass nrn = Dummy() nrn.soma = Dummy() nrn.soma.radius = 1.5 nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn)) nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 0.25)) nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 0.75)) nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.25)) nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.499)) nt.assert_false(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.5)) nt.assert_false(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.75)) nt.assert_false(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 2.5))
def test_has_nonzero_soma_radius_threshold(): class Dummy: pass nrn = Dummy() nrn.soma = Dummy() nrn.soma.radius = 1.5 assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn) assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 0.25) assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 0.75) assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.25) assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.499) assert not nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.5) assert not nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 1.75) assert not nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn, 2.5)
def test_has_nonzero_soma_radius_bad_data(): nrn = load_neuron(os.path.join(SWC_PATH, 'Single_basal.swc')) nt.assert_false(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn).status)
def test_has_nonzero_soma_radius(): nrn = load_neuron(os.path.join(SWC_PATH, 'Neuron.swc')) nt.assert_true(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn))
def test_has_nonzero_soma_radius_bad_data(): nrn = load_neuron(SWC_PATH / 'soma_zero_radius.swc') nt.assert_false(nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn).status)
def time_has_nonzero_soma_radius(self): nc.has_nonzero_soma_radius(self.neuron, threshold=0.0)
def test_has_nonzero_soma_radius(): nrn = load_neuron(SWC_PATH / 'Neuron.swc') assert nrn_chk.has_nonzero_soma_radius(nrn)