def test_OneSampleTTest_outputs():
output_map = dict(
beta_file=dict(),
dof_file=dict(),
error_file=dict(),
error_stddev_file=dict(),
error_var_file=dict(),
estimate_file=dict(),
frame_eigenvectors=dict(),
ftest_file=dict(),
fwhm_file=dict(),
gamma_file=dict(),
gamma_var_file=dict(),
glm_dir=dict(),
mask_file=dict(),
sig_file=dict(),
singular_values=dict(),
spatial_eigenvectors=dict(),
svd_stats_file=dict(),
)
outputs = OneSampleTTest.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_OneSampleTTest_outputs():
output_map = dict(beta_file=dict(),
dof_file=dict(),
error_file=dict(),
error_stddev_file=dict(),
error_var_file=dict(),
estimate_file=dict(),
frame_eigenvectors=dict(),
ftest_file=dict(),
fwhm_file=dict(),
gamma_file=dict(),
gamma_var_file=dict(),
glm_dir=dict(),
mask_file=dict(),
sig_file=dict(),
singular_values=dict(),
spatial_eigenvectors=dict(),
svd_stats_file=dict(),
)
outputs = OneSampleTTest.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_OneSampleTTest_inputs():
input_map = dict(allow_ill_cond=dict(argstr='--illcond',
),
allow_repeated_subjects=dict(argstr='--allowsubjrep',
),
args=dict(argstr='%s',
),
calc_AR1=dict(argstr='--tar1',
),
check_opts=dict(argstr='--checkopts',
),
compute_log_y=dict(argstr='--logy',
),
contrast=dict(argstr='--C %s...',
),
cortex=dict(argstr='--cortex',
xor=['label_file'],
),
debug=dict(argstr='--debug',
),
design=dict(argstr='--X %s',
xor=('fsgd', 'design', 'one_sample'),
),
diag=dict(),
diag_cluster=dict(argstr='--diag-cluster',
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
fixed_fx_dof=dict(argstr='--ffxdof %d',
xor=['fixed_fx_dof_file'],
),
fixed_fx_dof_file=dict(argstr='--ffxdofdat %d',
xor=['fixed_fx_dof'],
),
fixed_fx_var=dict(argstr='--yffxvar %s',
),
force_perm=dict(argstr='--perm-force',
),
fsgd=dict(argstr='--fsgd %s %s',
xor=('fsgd', 'design', 'one_sample'),
),
fwhm=dict(argstr='--fwhm %f',
),
glm_dir=dict(argstr='--glmdir %s',
genfile=True,
),
hemi=dict(),
ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
in_file=dict(argstr='--y %s',
copyfile=False,
mandatory=True,
),
invert_mask=dict(argstr='--mask-inv',
),
label_file=dict(argstr='--label %s',
xor=['cortex'],
),
mask_file=dict(argstr='--mask %s',
),
no_contrast_sok=dict(argstr='--no-contrasts-ok',
),
no_est_fwhm=dict(argstr='--no-est-fwhm',
),
no_mask_smooth=dict(argstr='--no-mask-smooth',
),
no_prune=dict(argstr='--no-prune',
xor=['prunethresh'],
),
one_sample=dict(argstr='--osgm',
xor=('one_sample', 'fsgd', 'design', 'contrast'),
),
pca=dict(argstr='--pca',
),
per_voxel_reg=dict(argstr='--pvr %s...',
),
profile=dict(argstr='--profile %d',
),
prune=dict(argstr='--prune',
),
prune_thresh=dict(argstr='--prune_thr %f',
xor=['noprune'],
),
resynth_test=dict(argstr='--resynthtest %d',
),
save_cond=dict(argstr='--save-cond',
),
save_estimate=dict(argstr='--yhat-save',
),
save_res_corr_mtx=dict(argstr='--eres-scm',
),
save_residual=dict(argstr='--eres-save',
),
seed=dict(argstr='--seed %d',
),
self_reg=dict(argstr='--selfreg %d %d %d',
),
sim_done_file=dict(argstr='--sim-done %s',
),
sim_sign=dict(argstr='--sim-sign %s',
),
simulation=dict(argstr='--sim %s %d %f %s',
),
subject_id=dict(),
subjects_dir=dict(),
surf=dict(argstr='--surf %s %s %s',
requires=['subject_id', 'hemi'],
),
surf_geo=dict(usedefault=True,
),
synth=dict(argstr='--synth',
),
terminal_output=dict(mandatory=True,
nohash=True,
),
uniform=dict(argstr='--uniform %f %f',
),
var_fwhm=dict(argstr='--var-fwhm %f',
),
vox_dump=dict(argstr='--voxdump %d %d %d',
),
weight_file=dict(xor=['weighted_ls'],
),
weight_inv=dict(argstr='--w-inv',
xor=['weighted_ls'],
),
weight_sqrt=dict(argstr='--w-sqrt',
xor=['weighted_ls'],
),
weighted_ls=dict(argstr='--wls %s',
xor=('weight_file', 'weight_inv', 'weight_sqrt'),
),
)
inputs = OneSampleTTest.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value