Exemplos de should_run_fusion em Python

Exemplo n.º 1

def _should_run_fusion(config):
    CALLER = 'tophat'
    return config_utils.should_run_fusion(CALLER, config)

Exemplo n.º 2

def test_should_not_run_fusion_when_fusion_mode_and_wrong_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion('OTHER', config)
    assert result is False

Exemplo n.º 3

def test_should_run_fusion_when_fusion_mode_and_right_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion('TEST', config)
    assert result is True

Exemplo n.º 4

def test_should_not_run_fusion_when_fusion_mode_false(config):
    result = config_utils.should_run_fusion(mock.Mock(), config)
    assert result is False

Exemplo n.º 5

def test_should_run_fusion_when_fusion_mode_and_default_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion(mock.Mock(), config)
    assert result is True

Exemplo n.º 6

Arquivo: star.py Projeto: biocyberman/bcbio-nextgen

def _should_run_fusion(config):
    CALLER = 'star'
    return config_utils.should_run_fusion(CALLER, config)

Exemplo n.º 7

Arquivo: test_config_utils.py Projeto: biocyberman/bcbio-nextgen

def test_should_run_fusion_when_fusion_mode_and_right_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion('TEST', config)
    assert result is True

Exemplo n.º 8

Arquivo: test_config_utils.py Projeto: biocyberman/bcbio-nextgen

def test_should_not_run_fusion_when_fusion_mode_and_wrong_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion('OTHER', config)
    assert result is False

Exemplo n.º 9

Arquivo: test_config_utils.py Projeto: biocyberman/bcbio-nextgen

def test_should_run_fusion_when_fusion_mode_and_default_caller(config):
    result = config_utils.should_run_fusion(mock.Mock(), config)
    assert result is True

Exemplo n.º 10

Arquivo: test_config_utils.py Projeto: biocyberman/bcbio-nextgen

def test_should_not_run_fusion_when_fusion_mode_false(config):
    result = config_utils.should_run_fusion(mock.Mock(), config)
    assert result is False