Exemplo n.º 1
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_cmap(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(cmap=cm.inferno,
                               same_plot=False,
                               dpi=DPI,
                               save=fpath)
Exemplo n.º 2
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_title(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(title="foobar", dpi=DPI, save=fpath)
Exemplo n.º 3
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_no_same_plot(self, mc: GPCCA,
                                                fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(same_plot=False, dpi=DPI, save=fpath)
Exemplo n.º 4
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_cluster_key(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(cluster_key="clusters", dpi=DPI, save=fpath)
Exemplo n.º 5
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_n_cells(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(n_cells=5, dpi=DPI, save=fpath)
Exemplo n.º 6
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_lineages(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(lineages=["0"], dpi=DPI, save=fpath)
Exemplo n.º 7
0
 def test_scvelo_gpcca_meta_states_time(self, mc: GPCCA, fpath: str):
     mc.plot_metastable_states(mode="time", dpi=DPI, save=fpath)