Exemplos de chains_to_seqs em Python

Exemplo n.º 1

 def test_chains_to_seqs_protein(self):
     """Tests for chains_to_seqs function using protein pdb chains.
     """
     seqs, seqtypes = chains_to_seqs(self.test_pdb_chains_2)
     self.assertEqual(seqs, self.test_pdb_seqs_2)
     self.assertEqual(seqtypes, self.test_pdb_types_2)

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_pdb_color.py Projeto: miklou/pycogent

 def test_chains_to_seqs_protein(self):
     """Tests for chains_to_seqs function using protein pdb chains.
     """
     seqs, seqtypes = chains_to_seqs(self.test_pdb_chains_2)
     self.assertEqual(seqs, self.test_pdb_seqs_2)
     self.assertEqual(seqtypes, self.test_pdb_types_2)

Exemplo n.º 3

 def test_chains_to_seqs_nucleotide(self):
     """Tests for chains_to_seqs function using nucleotide pdb chains.
     """
     seqs, seqtypes = chains_to_seqs(self.test_pdb_chains_1)
     self.assertEqual(seqs, self.test_pdb_seqs_1)
     self.assertEqual(seqtypes, self.test_pdb_types_1)

Exemplo n.º 4

Arquivo: test_pdb_color.py Projeto: miklou/pycogent

 def test_chains_to_seqs_nucleotide(self):
     """Tests for chains_to_seqs function using nucleotide pdb chains.
     """
     seqs, seqtypes = chains_to_seqs(self.test_pdb_chains_1)
     self.assertEqual(seqs, self.test_pdb_seqs_1)
     self.assertEqual(seqtypes, self.test_pdb_types_1)